农民工工资专用账户是专为农民工设立的，用于支付他们通过务工获得的劳动报酬，确保农民工工资能够按时、足额发放，防止被拖欠或挪用。根据相关法律法规和监管要求，该账户应专款专用，不可用于发放项目部管理人员的工资。项目部管理人员通常不属于农民工范畴，而是企业的正式员工或管理层，其工资应按照公司的正常薪酬制度和流程进行发放。

若违规使用农民工工资专用账户发放非农民工工资，如项目部管理人员的工资，将可能面临责令限期改正、项目停工、罚款等法律后果，并可能影响企业在建筑市场的信用评价。

因此，建议企业和项目部应严格遵守《保障农民工工资支付条例》及相关法规政策的要求，规范使用农民工工资专用账户，确保专款专用。同时，应规范薪酬体系，对于项目部管理人员的工资发放，按照公司的正常薪酬制度和流程进行操作，避免与农民工工资混同。相关部门也应加强监管力度，定期对农民工工资专用账户的使用情况进行检查，确保合规使用。