车辆扣12分不能用两本驾驶证扣分。下面我详细为你解释一下：
法律依据
根据《道路交通安全法》第二十四条的规定，公安机关交通管理部门对机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规的行为，除依法给予行政处罚外，还实行累积记分制度。当累积记分达到规定分值时，会扣留机动车驾驶证，并对驾驶人进行道路交通安全法律、法规教育，重新考试。考试合格后，才会发还驾驶证，并记分清零。
具体分析
记分制度：每个机动车驾驶人只有一个驾驶证，记分是针对个人驾驶证的，而不是针对车辆的。因此，当某个驾驶人的记分达到12分时，他必须按照法律规定接受处理，不能通过使用其他驾驶证来分散或抵消记分。
合法性与合规性：使用两本驾驶证来处理同一辆车的违章记分是违法的。这种行为不仅违反了交通法规，还可能涉及其他法律风险，如妨碍执法等。
处理流程：在实际情况中，当车辆发生违章并被记分时，必须是由实际参与交通违法行为的相关人员对应的驾照来处理。处理人需要携带本人驾照、行驶证等相关证件到交通管理部门办理，工作人员会核实违章情况及处理人的身份信息。
结论与建议
因此，车辆扣12分不能用两本驾驶证扣分。如果你或你身边的人遇到了类似的情况，建议遵守法律规定，按照正规流程处理违章记分。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。