针对您提出的“车辆有违章车牌遗失怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，当您的车牌遗失时，需要尽快向车辆管理所申请补领新的车牌。这一步骤是必要的，因为车牌是车辆的重要识别标志，也是合法上路行驶的必备条件。同时，由于您的车辆存在违章记录，处理违章事宜也是必不可少的。不过，车牌遗失与处理违章是两个相对独立的流程，可以分别进行。

关于车牌遗失的补领流程，您可以选择通过“交管12123”APP进行线上申请，或者亲自前往车辆管理所的窗口办理。如果您选择线上申请，只需按照APP内的指引，填写相关资料，包括业务类型（补领号牌）、申请原因（号牌灭失或丢失）、临牌邮寄地址等，并提交申请。在提交申请后，请确保所填信息准确无误，因为一旦提交成功，将不允许退办。之后，您只需等待邮政工作人员上门收取可能的原号牌（如果是换领）并寄送新号牌给您。

另外，值得注意的是，在补发、换发号牌期间，您可以申领有效期不超过十五日的临时行驶车号牌，以确保您的车辆在等待新号牌期间能够合法上路行驶。同时，一旦新号牌补发或换发成功，原机动车号牌将作废，您不得再继续使用。

至于处理违章事宜，您可以在车牌补领的同时或之后进行。通常，处理违章需要您携带相关证件（如驾驶证、行驶证等）前往交警部门或指定的违章处理窗口进行办理。根据违章的具体情况，您可能需要缴纳罚款、接受处罚或参加相关的交通安全教育活动。

综上所述，当您的车辆出现违章且车牌遗失时，您应首先尽快补领新的车牌，并妥善处理违章事宜。希望以上解答能够对您有所帮助。如有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询。