如果发现身份信息被朋友拿去注册公司并持股，这确实是一个比较严重的问题，需要您及时采取行动来维护自己的合法权益。以下是一套详细的处理建议，希望能帮助您解决这个问题：

一、明确情况与收集证据

1. 确认信息：

   • 首先，确认自己的身份信息确实被用于注册公司并持股，可以通过查询相关公司的工商登记信息来核实。

2. 收集证据：

   • 保留身份证原件及复印件作为身份证明。
   • 收集与朋友的聊天记录、通话录音等，作为关键证据，证明你并未授权其使用你的身份信息。
   • 前往当地工商行政管理部门申请调取涉事公司的工商登记档案资料，寻找更多线索。

二、向工商部门投诉

1. 提交书面申请：

   • 携带收集到的证据材料，向该公司注册地的工商行政管理部门提出书面投诉。
   • 在申请中详细说明身份证被冒用的情况，包括被注册公司的名称、注册时间、持股情况等。

2. 要求调查核实与撤销登记：

   • 请求工商部门对公司注册及持股行为进行调查核实。
   • 如确认身份被冒用，要求工商部门撤销相关的公司登记及持股记录。

三、报警处理

1. 向公安机关报案：

   • 向你户籍所在地或常住地的公安机关报案，说明身份证被冒用的具体情况。
   • 提供所有收集到的证据材料，以便警方进行调查。

2. 配合警方调查：

   • 警方将进行调查，以确定是否存在冒用身份的违法犯罪行为。
   • 你需要积极配合警方的工作，提供必要的协助和信息。

四、法律途径（若必要）

1. 提起行政诉讼：

   • 如果工商部门经过调查后未支持你撤销公司登记及持股的诉求，或对处理结果不满意，你可以依法向有管辖权的人民法院提起行政诉讼。
   • 在诉讼过程中，务必提供充分证据证明身份证被冒用的事实。

2. 咨询专业律师：

   • 在整个处理过程中，咨询专业律师的意见是非常必要的。
   • 律师可以帮助你准备法律文件、提供法律咨询和支持，确保你的权益得到充分保护。

五、信用修复与预防

1. 寻求信用修复：

   • 如果公司登记及持股记录最终被撤销，但你的个人信用可能已受影响，此时可向相关信用管理机构提出信用修复申请。
   • 提交身份被冒用及问题已解决的证明材料，要求恢复良好信用记录。

2. 加强个人信息保护：

   • 为预防类似事件再次发生，应加强个人信息的保护意识。
   • 不要随意透露身份证等敏感信息给他人，特别是不要将身份证借给他人使用或保管。

综上所述，一旦发现身份信息被朋友拿去注册公司并持股，应立即采取行动。通过收集证据、向工商部门投诉、报警处理、提起行政诉讼（若必要）、寻求信用修复以及咨询专业律师等措施，你可以有效地维护自己的合法权益。同时，加强个人信息保护也是预防此类事件再次发生的关键。