灵活就业可以转入公司社保。当灵活就业人员找到新工作并与单位签订劳动合同后，需要按照以下流程办理社保转入手续：

首先，个人需要前往之前办理灵活就业社保的机构或部门，办理停止缴费手续，退出灵活就业参保方式。这一步是确保个人的社保关系能够从灵活就业状态顺利过渡到单位职工状态。

接下来，由新用人单位的社保经办人员或人力资源部门负责为新员工办理就业参保手续。他们会按照单位职工的社保缴费标准，为员工缴纳社保费用，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等（具体根据当地政策可能有所不同）。

关于之前以灵活就业人员身份缴纳的养老保险费，不会因转入公司社保而清零。无论是灵活就业期间的缴费年限还是养老保险个人账户储存额，都会与之后的公司社保缴费年限和个人账户储存额累计计算，确保个人的社保权益不受损失。

总的来说，灵活就业转入公司社保是一个相对简单且顺畅的过程，只需要个人和用人单位按照相关流程办理即可。如有任何疑问或需要进一步的帮助，建议咨询当地社保机构或用人单位的社保经办人员。