在民事案件中，当事人申请回避是一个重要的程序性权利，旨在确保审判的公正性和独立性。以下是对当事人申请回避时法院如何处理的详细解答：
一、申请回避的主体与时间
- 主体：在民事诉讼中，申请回避的主体是当事人。
- 时间：当事人一般应在案件开始审理时提出回避申请。如果回避事由在案件开始审理后才知晓，那么可以在法庭辩论终结前提出。
二、申请回避的理由
当事人可以基于以下理由申请回避：
- 审判人员是本案的当事人或是当事人的近亲属。
- 审判人员与本案有利害关系。
- 审判人员曾担任过本案的证人、鉴定人、辩护人、诉讼代理人。
- 审判人员与本案当事人、诉讼代理人有其他关系，可能影响案件的公正处理或审理。
- 审判人员接受当事人、诉讼代理人请客送礼，或违反规定会见当事人、诉讼代理人的。
三、申请回避的方式
当事人可以通过口头或书面形式提出回避申请。如果是口头申请，法院应记录在案。申请时应明确说明回避的理由和事实，并尽可能提交相应证据予以证明。
四、回避的决定程序
- 审查：法院在接到回避申请后，会依法对回避理由进行审查。
- 决定主体：
- 院长担任审判长时的回避，由审判委员会决定。
- 审判人员的回避，由院长决定。
- 其他人员的回避，如书记员、翻译人员等，由审判长决定。
- 决定作出：法院应当在申请提出的三日内，以口头或者书面形式作出决定。
五、复议程序
- 申请复议：如果当事人对法院驳回回避申请的决定不服，可以在接到决定时申请复议一次。
- 复议期间：复议期间，被申请回避的人员不停止参与本案的工作，除非案件需要采取紧急措施。
- 复议决定：人民法院对复议申请应在三日内作出复议决定，并通知复议申请人。
六、特殊情况处理
如果当事人申请的是法院整体回避，这在实际操作中较为罕见。法院会审查该申请，如果认为自己确实没有管辖权或存在其他影响公正审理的情况，可以适用指定管辖或移送管辖的制度，将案件移送给有管辖权的人民法院。
综上所述，当事人在民事案件中申请回避是一个严谨而细致的过程，需要遵循一定的程序和规定。法院在处理回避申请时也会依法进行审查并作出决定，以确保审判的公正性和独立性。