当公司在进行注销清算时，处理留抵的增值税进项税额是一个需要特别注意的问题。以下是对这一问题的详细解答：

首先，我们要明确留抵税额的性质。留抵税额是指企业在日常经营中，由于各种原因（如购进货物、接受服务等）已经支付并计入成本的增值税额，但在销售商品或提供服务时未能完全抵扣完毕的税额部分。这部分税额在企业的“应交税费-应交增值税”科目下以负值的形式体现。

接下来，我们分析留抵税额在清算时的处理。根据《中华人民共和国企业所得税法实施条例》的规定，企业所得税税前扣除遵循实际发生和负担原则。通常情况下，允许抵扣的增值税能够通过销售商品或提供服务等方式转嫁给购买方，因此不被视为企业实际负担的税金，不允许在税前扣除。然而，在注销清算的特殊情况下，留抵的增值税进项税额由于无法继续抵扣且不予退税，实际上成为了企业最终负担的税金。

针对这种情况，根据《关于企业清算业务企业所得税处理若干问题的通知》（财税〔2009〕60号）的规定，企业的清算所得是指企业的全部资产可变现价值或交易价格，减除资产的计税基础、清算费用、相关税费后，加上债务清偿损益等后的余额。在这里，“相关税费”并不包括留抵的增值税进项税额，因为该税额在清算时并未实际缴纳。然而，由于留抵税额在清算时清偿价值为0，产生了负债清偿损失，这部分损失被视为“债务清偿损益”，可以冲减清算所得。

最后，我们需要注意的是，《国家税务总局关于小规模纳税人免征增值税等征收管理事项的公告》（2022年第6号）也明确了一般纳税人转登记为小规模纳税人时，其未抵扣的进项税额可以在规定的时间内按规定在企业所得税或个人所得税税前扣除。这一规定与允许清算时留抵税额在税前扣除的口径是一致的。

综上所述，企业注销清算时无法继续抵扣且不予退税的留抵税额，允许在企业所得税税前扣除。这一处理方式既符合企业所得税税前扣除的实际发生和负担原则，也体现了对企业注销清算时特殊情况的考虑。