当公司面临注销时，处理留抵的增值税进项税额是一个重要的税务问题，需要遵循相关税务法规。以下是对这一问题的详细解答：
一、一般情况：留抵税额不予退还
根据《财政部 国家税务总局关于增值税若干政策的通知》（财税〔2005〕165号）第六条的规定，对于一般纳税人注销或被取消辅导期一般纳税人资格并转为小规模纳税人时，其存货不作进项税额转出处理，同时，其留抵税额也不予以退税。这意味着，在正常的公司注销流程中，增值税留抵税额是不能办理退税手续的，该部分税额将由企业自行承担损失。这是因为进项税额原本用于抵扣未来销售商品或提供服务时产生的销项税额，但公司注销后将不再进行经营活动，因此留抵的进项税额失去了抵扣的机会。
二、特殊情况：资产重组可结转留抵税额
尽管在一般情况下留抵税额不予退还，但在某些特殊情况下，如资产重组，留抵税额是可以结转继续抵扣的。具体依据为《国家税务总局关于纳税人资产重组增值税留抵税额处理有关问题的公告》（国家税务总局公告2012年第55号）。该公告规定，当增值税一般纳税人在资产重组过程中，将全部资产、负债和劳动力一并转让给其他增值税一般纳税人，并按程序办理注销税务登记时，其在办理注销登记前尚未抵扣的进项税额可以结转至新纳税人处继续抵扣。
在实际操作中，这需要原纳税人主管税务机关认真核查资产重组相关资料，核实原纳税人在办理注销税务登记前尚未抵扣的进项税额，并填写相应的转移单。新纳税人主管税务机关在核对无误后，会允许新纳税人继续申报抵扣这部分留抵税额。
三、注意事项与建议
了解政策差异：具体的税务处理可能会因地区和政策的不同而有所差异。因此，在注销前，建议务必咨询当地税务局以获取更准确的信息和指导。
妥善保管资料：无论是哪种情况下的注销，企业都应妥善保管好相关税务资料和凭证，如进项税额的发票、抵扣凭证等。这些资料在后续可能需要用于核查和证明。
及时咨询专业机构：在注销过程中遇到任何税务问题或疑问，应及时向专业税务机构或律师咨询。他们可以提供专业的建议和帮助，确保税务处理的合法性和准确性。
综上所述，公司注销时留抵的增值税进项税额的处理方式需根据具体情况而定。在一般情况下，留抵税额不予退还；但在资产重组等特殊情况下，留抵税额可以结转继续抵扣。企业应充分了解相关政策规定，并在注销前做好充分的准备工作。