企业注销时留抵的增值税处理方式主要依据具体的税务法规和企业注销的具体情况来定。以下是对不同情况下留抵增值税处理方式的详细解答：
一、一般情况：留抵税额不予退还
根据《财政部 国家税务总局关于增值税若干政策的通知》（财税〔2005〕165号）第六条的规定，如果企业因经营期限届满、经营不善或其他原因终止生产经营活动并需要办理税务注销，其存货不作进项税额转出处理，留抵税额也不予以退税。
在这种情况下，企业可以在办理注销前通过变卖存货及资产来充分抵扣相应的留抵税额，然后再办理注销登记。如果企业没有可变卖处置的存货和资产，那么注销企业的留抵税额可以根据企业所得税法及其实施条例的有关规定，在注销清算时视情况直接计入当期费用，并在企业所得税税前扣除，或作为资产损失，在计算应纳税所得额时扣除。
二、特殊情况：资产重组可结转留抵税额
对于通过资产重组方式注销的企业，留抵税额的处理方式有所不同。根据《国家税务总局关于纳税人资产重组增值税留抵税额处理有关问题的公告》（国家税务总局公告2012年第55号），如果增值税一般纳税人在资产重组过程中将全部资产、负债和劳动力一并转让给其他增值税一般纳税人，并按程序办理注销税务登记，那么其在办理注销登记前尚未抵扣的进项税额可以结转至新纳税人处继续抵扣。
在实际操作中，这需要原纳税人的主管税务机关核查资产重组相关资料，核实原纳税人在办理注销税务登记前尚未抵扣的进项税额，并填写《增值税一般纳税人资产重组进项留抵税额转移单》。新纳税人的主管税务机关在核对无误后，会允许新纳税人继续申报抵扣这部分留抵税额。
三、其他注意事项与建议
政策差异：具体的税务处理可能会因地区和政策的不同而有所差异。因此，在注销前务必咨询当地税务局或专业税务机构以获取更准确的信息和指导。
及时申请退税：如果企业符合小微企业和制造业等行业的增值税留抵退税条件（如根据财政部、税务总局发布的《关于进一步加大增值税期末留抵退税政策实施力度的公告》等），可以在办理注销前向主管税务机关申请退还留抵税额。
资料准备：无论是哪种情况下的注销，企业都应妥善保管好相关税务资料和凭证，如进项税额的发票、抵扣凭证等，以便在需要时进行核查和证明。
及时咨询：在注销过程中遇到任何税务问题或疑问，应及时向专业税务机构或律师咨询，以确保税务处理的合法性和准确性。
综上所述，企业注销时留抵的增值税处理方式需根据具体情况而定。企业应充分了解相关政策规定，并在注销前做好充分的准备工作，以确保税务处理的合规性和准确性。