3岁的孩子是可以办理港澳通行证的。根据相关规定，内地居民，包括未成年人，都可以向全国任一公安机关出入境管理窗口申请办理中华人民共和国普通护照、往来港澳通行证及相关的签注。
对于3岁的孩子来说，办理港澳通行证时需要由监护人陪同前往，如果监护人无法陪同，还可以委托他人陪同，但需要提供监护人委托书原件以及陪同人的身份证件复印件并交验原件。此外，还需要准备以下材料：
在办理流程上，首先需要预约办理时间，这通常可以通过当地的出入境管理局的官方网站或者公众号进行预约。预约成功后，按照预约的时间地点，带上所需的所有材料前往办理即可。取证方式也是在预约时选择的，可以选择邮寄或者到指定地点自取。
需要注意的是，由于孩子的成长变化可能比较大，所以在自助机上办理签注时可能会遇到人脸识别认证失败的情况。如果遇到这种情况，可以预约到出入境大厅的人工窗口进行办理，家长可以代为签注。代为签注时需要携带孩子的港澳通行证、身份证（如果有的话）、出生证明和户口本（用于证明亲属关系），以及家长的身份证。
总的来说，3岁的孩子是可以办理港澳通行证的，只需要按照相关规定准备好材料并进行预约办理即可。