关于“甲供材施工单位是否需要交增值税”的问题，这主要取决于具体的计税方式以及合同约定。以下是对此问题的详细解答：

一、甲供材的定义与背景

“甲供材”指的是由甲方（通常是房地产开发企业）提供全部或部分施工材料，供乙方（施工单位）在项目施工过程中使用。在这种模式下，施工单位可以选择一般计税或简易计税两种方式进行税务处理。

二、计税方式与增值税缴纳

1. 一般计税方式：

   • 施工单位如果选择一般计税方式，需要开具9%的增值税发票。
   • 在这种计税方式下，施工单位需要就其所提供的建筑服务（不含甲供材部分）缴纳增值税。

2. 简易计税方式：

   • 根据《财政部 税务总局关于建筑服务等营改增试点政策的通知》，如果建筑工程总承包单位为房屋建筑的地基与基础、主体结构提供工程服务，且建设单位自行采购全部或部分钢材、混凝土、砌体材料、预制构件，则适用简易计税方法计税。
   • 在这种情况下，施工单位需要开具3%的增值税发票。
   • 简易计税方式下，施工单位同样需要就其所提供的建筑服务（不含甲供材部分）缴纳增值税，但税率较低。

三、甲供材的税务处理

• 在甲供材模式下，施工单位无论选择哪种计税方式，都需要特别注意房地产企业可能存在的重复扣除“甲供材”成本而少缴税款的问题。
• 如果房地产企业在与施工单位结算时选择了总额法（即包含甲供材部分的总价进行结算），那么可能会存在重复抵扣增值税进项税、重复扣除企业所得税成本以及土地增值税计算不准确等问题。
• 为了避免这些问题，建议房地产企业在与施工单位签订合同时明确计税方式，并在工程结算时采用差额法（即不包含甲供材部分的价格进行结算）。

四、结论

综上所述，甲供材施工单位是否需要交增值税取决于具体的计税方式以及合同约定。在一般计税或简易计税方式下，施工单位都需要就其所提供的建筑服务（不含甲供材部分）缴纳增值税。同时，为了避免税务风险，建议房地产企业与施工单位在签订合同时明确计税方式，并在工程结算时采用合理的结算方法。