关于二级主任科员与实职正科退休工资的差别，这个问题涉及公务员退休待遇的具体规定，而退休工资的差别通常受到多种因素的影响，包括但不限于职务、级别、工龄、缴费年限以及当地的政策规定等。

首先，需要明确的是，二级主任科员和实职正科在公务员体系中的职务和级别是不同的，这直接影响到他们的基本工资和津贴补贴。在退休时，这些差异会反映到退休工资上。

具体来说，以下几个方面可能导致二者退休工资的差别：

1. 基本工资差异：二级主任科员和实职正科的基本工资不同，基本工资的高低直接影响到退休后的基础养老金计算。基本工资越高，退休后领取的基础养老金也相应越多。

2. 津贴补贴差异：在职时，不同职务和级别的公务员享受的津贴补贴也不同。这些津贴补贴在退休后可能以一定比例继续发放，从而影响退休工资的总额。

3. 缴费年限和缴费基数：公务员的养老保险缴费年限和缴费基数也会影响退休工资。如果二级主任科员和实职正科的缴费年限或缴费基数存在差异，那么他们的退休工资也会有所不同。

4. 政策规定：不同地区的公务员退休政策可能存在差异，包括退休工资的计算方法、发放标准等。因此，具体差别还需参考当地的相关政策规定。

综上所述，二级主任科员与实职正科退休工资的差别是由多种因素共同决定的。要准确了解二者之间的差别，需要具体了解他们的基本工资、津贴补贴、缴费年限、缴费基数以及当地政策规定等情况。如果你有相关疑问或需要更详细的解答，可以直接向我咨询。