公司只发最低工资是否合法，需根据具体情况判断。以下是对不同情况下的详细分析：

1. 一般情况下的合法性判断：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条，国家实行最低工资保障制度，用人单位支付的工资不得低于当地最低工资标准。因此，如果公司支付的工资不低于当地最低工资标准，且在员工正常出勤并完成工作任务的情况下，通常是合法的。
   • 然而，如果劳动合同中明确约定了高于最低工资的工资标准，公司应按照约定足额支付。否则，仅支付最低工资将违反合同约定及《劳动法》关于工资支付的规定。

2. 特殊情况下的违法性判断：

   • 未足额支付其他劳动报酬：公司除基本工资外，还需支付加班工资、津贴、补贴等其他应得报酬。若仅支付最低工资而未涵盖这些报酬，则构成违法。
   • 绩效考核不达标与合法调薪：公司有完善、合法的绩效考核制度，并经过民主程序制定及公示，员工知晓考核标准和后果。在此情况下，若员工绩效考核不达标，按照制度降低工资至不低于最低工资标准，则不违法。但若公司无故降低员工工资至最低工资，则违法。
   • 违反同工同酬原则：公司内部相同或相似岗位的员工应享受同等工资待遇。若对部分员工仅发放最低工资，而对从事相同工作的其他员工支付更高工资，则违反同工同酬原则，构成违法。
   • 特殊保护规定：对于女职工等特定群体，法律有额外保护。如因怀孕、生育、哺乳等原因仅发放最低工资，则违反《女职工劳动保护特别规定》，构成违法。

3. 非因劳动者原因停工停产的情况：

   • 非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，应按劳动合同规定的标准支付工资。
   • 超过一个工资支付周期的，若劳动者提供正常劳动，则支付的劳动报酬不得低于最低工资标准；若未提供正常劳动，应按国家有关规定办理（如发放生活费）。

综上所述，公司只发最低工资是否违法，需综合考虑多种因素，包括劳动合同约定、公司绩效考核制度、同工同酬原则以及特殊保护规定等。如果公司存在违法支付最低工资的情况，劳动者有权与公司沟通协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自身合法权益。