关于工程项目已使用视为工程合格的有关法律规定，主要依据的是《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》（以下简称《建工司法解释》）的相关规定。

核心结论：根据《建工司法解释》第十三条，建设工程未经竣工验收，发包人擅自使用后，又以使用部分质量不符合约定为由主张权利的，人民法院不予支持。但是承包人应当在建设工程的合理使用寿命内对地基基础工程和主体结构质量承担民事责任。

详细分析：

1. 视为合格的规定：

   • 建设工程未经过验收，发包人擅自使用后，即视为该工程已经合格。这是基于法律对发包人擅自使用行为的一种否定评价，并视为其对工程质量的一种默认接受。
   • 这种规定主要是为了保护施工方的合法权益，防止发包人恶意拖延验收或无故挑剔工程质量，以逃避支付工程款的义务。

2. 地基基础和主体结构的质量责任：

   • 尽管有“擅自使用视为合格”的规定，但承包人仍需对建设工程的地基基础和主体结构质量承担民事责任。
   • 这是因为地基基础和主体结构是建设工程的核心部分，直接关系到整个工程的安全性和稳定性。如果这部分出现质量问题，即使发包人擅自使用，也不能免除承包人的责任。

3. 擅自使用与工程质量问题的关联性：

   • 在实践中，需要判断发包人的擅自使用与工程质量问题之间是否存在关联性。如果工程质量问题与擅自使用无关，那么发包人不能以此为由拒绝支付工程款。
   • 如果工程质量问题确实与擅自使用有关，那么发包人可能需要承担相应的责任，但这并不影响承包人对地基基础和主体结构质量的责任承担。

综上所述，工程项目已使用视为工程合格的规定主要依据的是《建工司法解释》的相关规定。在实际操作中，需要综合考虑擅自使用与工程质量问题的关联性、地基基础和主体结构的质量责任等因素来做出判断。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。