房产证上标明为划拨土地性质的房屋是可以进行合法交易及过户的。但在交易过程中，需要遵循特定的法律程序和规定。以下是对这一问题的详细解答：
一、法律规定与交易流程
政府审批：
- 根据《城市房地产管理法》第四十条的相关规定，以划拨方式取得的土地使用权，在转让房地产时，需按照国务院的规定报有批准权的人民政府进行审批。这是确保交易合法性的关键步骤。
- 交易前，卖方必须向本地国土资源管理机构或相关政府部门提出申请，并等待审批通过。未经批准擅自进行的交易可能会面临交易无效的法律后果。
补缴土地出让金：
- 若政府批准转让，受让方通常需要办理土地使用权出让手续，并根据当地土地市场情况、土地用途、面积以及政府规定的标准，补缴相应的土地出让金。
- 补缴土地出让金是维护土地市场秩序和国家土地权益的必要举措，也是交易过程中的重要环节。
特殊情况处理：
- 在某些特殊情况下，如政府有特殊规划或政策要求，可能决定不办理土地使用权出让手续。此时，转让方需将转让房地产所获收益中的土地收益上缴国家或者按其他政府规定的方式处理。
二、风险与注意事项
交易风险：
- 由于划拨土地房屋交易需履行特定的审批手续，若手续不全或未获批准，交易将无法完成，可能导致买方遭受损失。
- 因此，在交易前应充分了解并确认所有必要的手续和条件是否已满足，以降低交易风险。
价值影响：
- 划拨土地上的房屋在市场价值上可能受到一定影响。补缴土地出让金会增加购房成本，使得房屋价格相对较高。
- 同时，一些购房者可能对划拨土地房屋的产权稳定性存在疑虑，从而影响其市场流通性和价格。
使用权归属：
- 划拨土地使用权是非所有权形式，仅代表使用权而非所有权。
- 在交易前，务必明确土地的使用权归属和转让的合法性，确保持有有效的国有土地使用权证书和房产证。
三、建议与总结
综上所述，房产证上标明为划拨土地性质的房屋在交易过程中需特别注意遵守相关法律法规和政府审批程序。为确保交易的合法性和有效性，建议在交易前咨询当地房地产管理部门或专业律师，了解具体的法律要求和操作流程。
同时，买方应充分了解并考虑划拨土地房屋可能存在的风险和价值影响，谨慎做出决策。通过谨慎处理每一个细节，可以有效降低交易风险，保障双方的合法权益。