您好，关于您提出的一次性补缴9万元农村基本养老保险金后，领取了3个月养老金但参保人去世，余下的钱是否能退回的问题，我可以给您一个详细的解答。

首先，城乡居民基本养老保险的缴费是计入个人账户的。如果在缴费后、还未开始领取养老金或者领取养老金的月数少于个人账户计发月数（通常为139个月）时参保人去世，那么其个人账户中剩余的部分是可以退还的。

具体到您的情况，由于已经一次性补缴了9万元，并且只领取了3个月的养老金，显然领取的月数远少于139个月，因此个人账户中应该还有较大的余额。这部分余额，在参保人去世后，是可以由其继承人申请退还的。

为了办理退保手续，您需要准备以下材料：参保人的死亡证明、继承人的身份证复印件、继承人与参保人的关系证明（如户口本等），以及继承人的银行账号。然后，您可以到属地的人社服务中心或者乡镇（街道）的便民服务中心进行申报。人社服务中心会统一上报到市级城乡居民社保所办理退保手续。

退保手续办理完成后，应退的本金、利息及政府补贴会存入您提供的退保人社保卡或指定银行账户中。

总的来说，根据您的情况，一次性补缴的农村基本养老保险金在参保人去世后，其个人账户中的余额是可以退还的。您只需要按照上述流程准备好相关材料，并到指定地点进行申报即可。