当股东不愿意变更股权时，可以采取以下措施来应对：

1. 协商沟通：

   • 首先，与不同意变更的股东进行充分沟通，了解其不同意的原因，尝试通过协商解决分歧。这可能需要对变更方案进行调整或提供额外的解释与保障，以达成双方都能接受的共识。

2. 依据公司章程：

   • 查看公司章程中对于股份变更的相关规定，如是否有特定的表决程序或条件。若符合规定，可按照程序进行变更，即使部分股东不同意，也能依据章程规定推进股权变更。

3. 法律途径：

   • 如果协商无果，且公司章程也未明确规定，可考虑通过法律途径解决。这包括向法院提起诉讼，请求法院判令该股东履行变更股权的义务。在诉讼过程中，需准备好公司章程、出资证明、股东会议决议等相关证据，以证明变更股权的合法性和必要性。
   • 需要注意的是，诉讼是较为复杂和耗时的方式，需要准备充分的证据和理由，并确保诉讼时效（一般为三年，从知道或者应当知道权利被侵害时起计算）未过期。

4. 后续执行：

   • 若诉讼胜诉且判决生效，可向工商行政管理部门申请变更登记，提交相关法律文书及证明材料，请求工商部门协助办理变更手续。

综上所述，处理股东不愿意变更股权的问题时，应首先尝试协商沟通，然后依据公司章程规定行事，若仍无法解决，则可通过法律途径来维护自身的合法权益。在整个过程中，保持冷静、理性，并注重证据的收集和保存，是解决问题的关键。