企业开具房屋租赁发票的税率确实是一个涉及多个因素的问题，以下是对企业出租房屋应缴纳税率的详细解答：

一、一般纳税人

1. 出租不动产（不含住房）

   • 2016年4月30日前取得的不动产：
     • 企业可以选择适用简易计税方法，此时税率为5%。
     • 若选择一般计税方法，则税率为9%。
   • 2016年5月1日后取得的不动产：
     • 适用一般计税方法，税率为9%。
     • 若不动产所在地与机构所在地不在同一县（市、区），需向不动产所在地主管税务机关预缴税款，并向机构所在地主管税务机关申报纳税。

2. 出租住房

   • 不论不动产取得时间，均按5%征收率减按1.5%计算应纳税额。

二、小规模纳税人

1. 出租不动产（不含住房及个人出租住房）

   • 统一按5%征收率计算应纳税额。
   • 若不动产所在地与机构所在地不在同一县（市），需向不动产所在地税务机关预缴税款，并向机构所在地税务机关申报纳税。

2. 出租住房

   • 同样享受税收优惠，按5%征收率减按1.5%计算应纳税额。

三、其他注意事项

• 企业在开具房屋租赁发票时，除了考虑税率外，还需关注是否享受税收优惠、是否需要预缴税款以及具体的申报纳税流程等。
• 建议企业在实际操作中严格遵守当地税务机关的规定和要求，确保准确计算税额并按时缴纳税款。
• 如对具体税率或计税方法存在疑问，建议咨询专业税务人员或律师以获取更具体的法律指导和帮助。

综上所述，企业开具房屋租赁发票的税率因纳税人身份、不动产取得时间、租赁用途以及是否享受税收优惠等多个因素而异。因此，在实际操作中应综合考虑各种因素，确保准确、合规地缴纳税款。