针对您提到的转店过程中遇到的法人变更与烟证问题，这里是一些建议和处理方式：
明确法人变更的费用承担：
- 首先，需要查看双方签订的转让合同或协议中，是否有关于法人变更费用承担的明确条款。如果有，按照合同约定执行。
- 如果没有明确条款，通常需要双方协商确定费用承担方式。一般而言，如果法人变更是因为转店需要，且对方在转店前已知情并同意，那么费用可能需由转店方（即您这一方）承担。
- 如果对方在转店后才提出法人变更需要收费，且此要求未在之前的协商或合同中明确，那么您可以考虑与对方协商减免或分担费用。
烟证的处理方式：
- 烟证作为经营许可的一部分，通常与店铺一同转让。需要确认烟证是否已包含在转让费用中，或者是否有单独的转让条款。
- 如果烟证是独立转让的，需要确保转让过程合法合规，即按照烟草专卖局的相关规定办理转让手续。
- 如果烟证与店铺一起转让，且转让合同中未特别说明烟证费用，那么烟证应视为转让的一部分，无需额外付费。
协商与解决：
- 在遇到费用争议时，首先尝试与对方友好协商，明确各自的权益和责任。
- 如果协商不成，可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师，通过法律途径解决争议。
作为拥有多领域法律实务经验的律师，我建议您在处理此类转店纠纷时，务必保留好所有相关证据，包括转让合同、聊天记录、支付凭证等，以便在需要时维护自己的合法权益。如果您有进一步的法律问题或需要详细的法律咨询，请随时向我提问，我将为您提供专业的法律帮助。