私企按最低基数扣公积金是否合法，取决于具体的法律规定和企业与员工的约定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法律规定：

   • 根据《住房公积金管理条例》及相关规定，住房公积金的缴存基数通常应为员工上一年度的月平均工资。然而，在实际操作中，各地可能会根据当地的经济情况、职工平均工资水平等因素，设定一个缴存基数的上下限。
   • 如果私企按照当地规定的最低基数来扣缴公积金，且这个最低基数不低于当地法定的最低工资标准，那么这种做法是合法的。

2. 企业与员工的约定：

   • 除了法律规定外，企业还可以与员工在劳动合同或相关协议中约定公积金的缴存基数。
   • 如果企业与员工明确约定了按最低基数扣缴公积金，且这一约定不违反当地的法律法规，那么企业按照约定执行也是合法的。

3. 特殊情况：

   • 如果私企未经员工同意或未按照当地规定擅自按最低基数扣缴公积金，且这个基数低于员工实际应缴的基数，那么这种做法是不合法的。
   • 另外，如果企业以降低公积金缴存基数为手段来规避法律责任或损害员工权益，也是不被允许的。

综上所述，私企按最低基数扣公积金是否合法，需要综合考虑法律规定、企业与员工的约定以及具体情况。如果你对此仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。