企业按最低工资交公积金的合法性，需要根据员工的实际工资水平与当地规定的最低缴存基数之间的关系，以及公司是否遵循了相关法律法规来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《住房公积金管理条例》第十六条，职工住房公积金的月缴存额应基于职工本人上一年度月平均工资与规定的缴存比例来确定。单位同样需按照这一原则为员工缴存住房公积金。
二、合法与不合法的情形
- 合法情形：
- 当员工的月工资收入低于或等于当地规定的住房公积金最低缴存基数时，单位按照该最低标准为其缴存住房公积金是符合法律规定的。例如，若当地最低缴存基数为2000元，员工月工资为1800元，单位按2000元为基数缴纳公积金即为合法。
- 不合法情形：
- 如果员工的实际工资高于当地规定的最低缴存基数，但单位却统一按最低标准缴纳，这就违反了《住房公积金管理条例》的规定。例如，员工上一年度月平均工资为8000元，而单位却按当地最低缴存基数2000元来缴纳，这种做法是不合法的。
三、员工权益与公司责任
- 员工权益：
- 住房公积金作为员工的重要福利，对于解决住房问题、提高生活质量具有重要意义。若公司未按员工实际工资水平缴纳公积金，将损害员工的合法权益，如购房贷款额度受限、养老及住房保障削弱等。
- 公司责任：
- 公司应按照员工实际工资水平合理确定缴存基数，以充分保障员工的权益。即使按最低标准缴纳在法律上可能合法，公司也应考虑员工的实际需求和利益，尽可能提高缴存水平。
- 如果公司违反规定，员工有权向住房公积金管理中心投诉或提起法律诉讼，公司可能需要承担补缴差额、支付罚款等法律责任。
四、法律救济途径
若劳动者认为单位缴纳的公积金不符合规定，可以采取以下措施进行维权：
- 与公司沟通协商：首先应与单位沟通协商，要求调整缴存基数。
- 向住房公积金管理中心投诉：协商不成时，可向当地住房公积金管理中心投诉举报，由管理中心责令单位限期改正；逾期不改的，可对单位处以罚款。
- 考虑法律诉讼：在极端情况下，如果员工认为公司的行为给自己造成了重大损失且其他途径无法解决问题时，可以考虑通过法律诉讼来维护自己的权益。
综上所述，企业按最低工资交公积金的合法性取决于员工的实际工资水平与当地最低缴存基数的关系。公司应遵守相关法律法规，合理确定缴存基数，以保障员工权益并促进自身长远发展。同时，员工也应充分了解自己的权益，并在发现公司存在违规行为时及时采取措施进行维权。