在刑事案件中，关于因查封、扣押发生的保管费用问题，我可以给出以下明确的回答：
通常情况下，因查封、扣押财物所产生的保管费用，应由作出查封、扣押决定的司法机关或行政机关承担。
分析说明：
法律依据：
- 根据相关法律及司法解释，司法机关或行政机关在办理案件过程中，对涉案财物采取查封、扣押措施时，有责任妥善保管这些财物，确保其安全完整。保管期间产生的费用，属于司法机关或行政机关的办案成本，因此应由其自行承担。
防止权力滥用：
- 这样的规定有助于防止司法机关或行政机关随意使用权力，避免将不合理的费用转嫁给当事人，从而保障当事人的合法权益。
特殊情况：
- 在极少数情况下，如果当事人自身行为导致保管难度增加或产生额外费用（例如，故意损坏被扣押财物或要求特殊保管条件等），并且这种增加的费用有明确的法律依据和合理界定，那么当事人可能需要承担部分费用。但这种情况较为罕见，且需严格依法判断。
举例说明：
- 假设小朱因涉嫌刑事案件，其部分物品被司法机关依法扣押。在案件办理期间，司法机关对扣押物品进行了妥善保管，并产生了相应的保管费用。在这种情况下，保管费用应由司法机关承担，而不应由小朱承担。
综上所述，刑事案件中因查封、扣押发生的保管费用，通常应由作出查封、扣押决定的司法机关或行政机关承担。如果当事人对此有疑问或遇到不当要求，可以依法维护自己的权益，必要时可向我咨询相关法律问题。