二楼改独立下水的合法性问题，需要从多个维度进行考量。以下是对这一问题的详细分析：
一、合法性的判断依据
法律法规遵守：
- 二楼住户在改造下水管道时，必须确保改造行为不违反国家及地方的相关法律法规，如《物业管理条例》、《建设工程质量管理条例》等。
建筑规范与安全：
- 改造方案应经过合理设计，确保不会对建筑物结构安全造成威胁，也不会影响其他住户的正常排水功能。
不侵犯他人权益：
- 改造行为不得损害其他业主的合法权益，如下水道堵塞、排水不畅等问题导致其他楼层受影响。
二、合法改造的条件
获得物业及相关部门批准：
- 在改造前，二楼住户需要按照小区物业管理要求向物业申报，并获得施工许可。如果改造涉及建筑主体或承重结构变动，还需委托具有相应资质的设计单位提出设计方案，并按方案施工。
遵守合同约定：
- 如果购房合同或与开发商、物业签订的相关协议中明确允许在一定条件下对排水系统进行改造，且二楼住户的改造行为符合这些约定，则改造行为属于合法。
三、不合法改造的情况
未经允许私自改造：
- 未经物业或相关部门许可擅自进行下水管道改造，将违反物业管理规定，物业有权要求其停止施工并恢复原状。
影响建筑结构安全：
- 如果改造行为破坏了建筑物主体或承重结构，将严重影响建筑的安全性，此类改造行为是违法的。
损害其他业主权益：
- 改造导致其他楼层排水问题，如堵塞、排水不畅等，将损害其他业主的合法权益，二楼住户需承担相应的法律责任。
四、建议与注意事项
充分沟通协商：
- 在进行改造前，二楼住户应与邻居和物业充分沟通协商，确保改造方案得到各方认可，避免引发不必要的纠纷。
咨询专业意见：
- 建议咨询当地相关部门或专业律师，了解具体的法律规定和要求，确保改造行为合法合规。
严格按照程序进行：
- 遵循法律法规和物业规定的程序进行申报和审批，确保改造行为符合所有相关要求。
综上所述，二楼改独立下水是否合法取决于改造行为是否满足相关法律法规、建筑规范以及不侵犯他人权益等条件。在进行改造前，建议二楼住户充分了解相关法律法规和物业规定，与邻居和物业充分沟通协商，并咨询专业意见以确保改造行为的合法性和合规性。