农民工工资在达到纳税标准后，确实需要依法缴纳个人所得税。这一点并不因其职业身份而有所区别，而是依据《中华人民共和国个人所得税法》的相关规定来执行。下面，我将从多个角度为您详细解释：
一、纳税标准与起征点
目前，我国个人所得税的起征点为每月5000元（针对工资、薪金所得等综合所得，按月计算）。这意味着，如果农民工的月工资收入超过这一标准，超出部分将作为应纳税所得额，需要按照一定的税率进行纳税。
二、税率与应纳税所得额计算
个人所得税采用超额累进税率，税率从3%至45%不等。应纳税所得额的计算方式为：月度收入减去5000元（免征额）、专项扣除（如三险一金等）、专项附加扣除（如子女教育、大病医疗等）以及依法确定的其他扣除后的余额。例如，若农民工小张月工资为8000元，不考虑其他扣除因素，其每月应纳税所得额为3000元（8000-5000），对应税率为3%，因此每月应纳个人所得税为90元（3000×3%）。
三、不同收入类型的税务处理
工资、薪金所得：如果农民工受雇于企事业单位，并签订了劳动用工合同，由支付方发放工资，那么其工资收入将按照“工资、薪金所得”项目代扣代缴税款，适用5%至45%的累进税率。
劳务报酬所得：对于短期内提供劳务并按次或按月取得报酬的农民工，支付方需按“劳务报酬所得”项目扣缴税款。月收入或单次收入低于4000元的，扣除800元费用后按20%税率纳税；高于4000元的，在扣除收入额20%的费用后再按20%税率纳税（若应纳税所得超过20000元，还需加成征收）。
个体工商户的生产经营所得：如果农民工办理了工商营业执照和税务登记证，从事个体经营，那么其所得应按“个体工商户的生产经营所得”项目适用5%至35%的累进税率纳税。
四、税务抵扣与优惠政策
税法提供了多项扣除项，以减轻纳税人的税收负担。这些扣除项包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等专项附加扣除。农民工若符合相关条件，可依法进行申报扣除，以降低税负。例如，如果农民工有子女在接受义务教育，那么这部分费用可以作为专项附加扣除，减少应纳税所得额。
五、实际案例与计算
假设农民工小李月工资为6000元，不考虑其他扣除因素，其每月应纳税所得额为1000元（6000-5000），对应税率为3%，因此每月应纳个人所得税为30元（1000×3%）。如果小李还有子女教育等专项附加扣除，那么应纳税所得额将进一步减少，税负也会相应降低。
六、建议与注意事项
了解纳税义务：农民工应了解自己的纳税义务，并按照规定进行纳税申报。如果雇主未代扣代缴税款，农民工应主动向税务机关申报并缴纳税款。
合理利用税收优惠政策：农民工应充分利用税法提供的抵扣和优惠政策，合理规划自己的税务事务，以降低税负。
保留相关凭证：农民工在申报扣除时，应保留好相关凭证，如子女教育的学费发票、住房贷款的还款记录等，以便在税务机关核查时提供证明。
综上所述，农民工工资在达到纳税标准后，必须依法缴纳个人所得税。具体的纳税方式、税率及应纳税所得额的计算会根据农民工取得收入的类型和金额而有所不同。如果您对个人所得税缴纳存在疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。