结论前置：公司营业执照注销后，员工在特定情况下仍然可以申请劳动仲裁来维护自身权益。具体能否仲裁，取决于公司注销前的清算情况、是否存在承继主体以及劳动争议的具体时效等因素。
一、可以申请劳动仲裁的情况
公司注销前未依法清算
- 法律依据与责任主体：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》的相关规定，若公司未经依法清算即办理法人注销登记，有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人需对公司债务承担相应赔偿责任。在此情况下，员工可以将这些主体列为被申请人，申请劳动仲裁要求支付未清偿的工资、经济补偿金等劳动债权。
- 举例说明：假设某公司因经营不善决定注销，但在注销前未对员工的工资和经济补偿金进行清算和支付。员工在得知公司注销后，可以向有限责任公司的股东或公司的实际控制人提出仲裁请求，要求其承担赔偿责任。
清算组成员存在过错
- 法律依据：同样依据上述规定，清算组成员在清算过程中违反法律、行政法规或公司章程给公司或债权人造成损失的，应承担赔偿责任。
- 仲裁对象与请求：若清算组成员在清算过程中存在过错，如故意隐瞒员工劳动债权未进行清偿，员工可以清算组成员为被申请人，要求其赔偿因过错导致的损失。
有承继主体
- 情况说明：若公司注销后有承继其权利义务的主体（如合并、分立后的公司），员工可以将该承继主体列为被申请人申请劳动仲裁。
- 举例说明：假设某公司在注销前与另一家公司进行了合并，合并后的公司承继了原公司的所有权利和义务。员工在得知原公司注销后，可以向合并后的公司提出仲裁请求，要求其承担原公司应支付的劳动债权。
劳动争议诉讼期间公司恶意注销
- 处理方式：在劳动争议诉讼期间，若公司恶意注销以逃避债务，劳动者可变更诉讼对象，向相关主体或个人进行维权。例如，可以向公司的股东或实际控制人提出仲裁请求或诉讼。
二、不可以申请劳动仲裁的情况
- 公司已依法清算并注销
- 情况说明：若公司在注销前已依法进行清算，并足额支付了员工工资、经济补偿金等各项费用，员工的劳动债权已得到妥善处理，此时员工再申请劳动仲裁将缺乏事实和法律依据，一般不会得到支持。
三、劳动仲裁的时效与注意事项
劳动仲裁时效
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年仲裁时效期间的限制；但劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
- 举例说明：假设某员工与公司于2022年1月终止劳动关系，但公司未支付其经济补偿金。员工应在2023年1月前向劳动仲裁机构提出仲裁请求，否则可能因超过时效而得不到支持。
申请劳动仲裁的注意事项
- 提交书面仲裁申请：当事人应提交书面仲裁申请书，并按被申请人数提交副本。申请书应载明劳动者的基本信息、用人单位的信息、仲裁请求及所依据的事实、理由等。
- 准备相关证据材料：劳动者在申请劳动仲裁时应准备充分的证据材料来支持自己的主张，如劳动合同、工资条、工作记录、银行流水等。这些证据材料对于证明劳动关系的存在、工资支付情况以及公司注销前的清算情况等至关重要。
四、建议与总结
公司营业执照注销后，员工并非完全丧失仲裁维权的可能。关键在于公司注销前的劳动争议情况、注销程序是否合法以及员工的权益是否在注销过程中得到妥善处理。因此，建议员工在遇到此类情况时：
- 及时了解公司注销前的清算情况：通过查询公司注销前的清算报告、公告等信息，了解公司是否依法进行了清算以及员工的劳动债权是否得到了妥善处理。
- 收集并保存相关证据材料：尽可能收集并保存与劳动关系、工资支付、公司注销等相关的证据材料，以备在申请劳动仲裁时使用。
- 咨询专业律师：虽然我在这里为你提供了详细的解答和建议，但每个具体案件都有其独特性和复杂性。因此，在遇到实际问题时，建议你直接向我咨询，以便我能根据你的具体情况提供更具体、更专业的法律帮助。
综上所述，公司营业执照注销后员工能否申请劳动仲裁取决于多种因素。在维权过程中，员工应综合考虑各种情况并采取相应措施来维护自己的合法权益。