问责申请书和控告书在法律文书性质、目的、内容侧重点以及提交对象等方面均存在显著区别。以下是对这两者的详细比较：

1. 法律文书性质与目的：

   • 问责申请书：通常是在某一事件或行为发生后，相关责任主体（如政府部门、企事业单位等）未履行其应尽职责或存在过错时，由受害者或相关利益方提出的一种要求追究责任、寻求赔偿或补救措施的书面申请。其目的在于促使责任主体正视问题，承担相应责任，并采取措施防止类似事件再次发生。
   • 控告书：则是一种正式的法律文书，用于向司法机关（如公安机关、检察机关等）揭发、控诉某人或某组织的犯罪行为，要求司法机关依法追究其刑事责任。控告书的目的在于启动刑事诉讼程序，维护社会秩序和公共利益。

2. 内容侧重点：

   • 问责申请书：内容通常包括事件概述、责任分析、损失评估、赔偿要求或补救措施建议等。它更注重于事实陈述和责任划分，以及提出具体的诉求或建议。
   • 控告书：内容则更侧重于犯罪行为的描述、证据列举、犯罪嫌疑人的身份信息以及控告人的诉求（即要求追究犯罪嫌疑人的刑事责任）。控告书需要确保所陈述的事实和提供的证据足以支持控告的成立。

3. 提交对象与程序：

   • 问责申请书：通常提交给相关责任主体（如政府部门、企事业单位等）或其上级主管部门，有时也可能提交给监察机关或信访部门。提交后，责任主体会进行内部调查和处理，并可能给出答复或采取补救措施。
   • 控告书：则必须提交给有管辖权的司法机关（如公安机关、检察机关等）。司法机关在收到控告书后，会进行审查，并根据情况决定是否立案侦查。如果立案，将进入刑事诉讼程序。

4. 法律后果与效力：

   • 问责申请书：其法律后果主要取决于责任主体的处理方式和态度。如果责任主体认可申请书中的诉求并采取相应措施，则问题可能得到解决；如果责任主体拒绝或忽视申请书，则申请方可能需要通过其他途径（如行政复议、行政诉讼等）来维护自己的权益。
   • 控告书：一旦司法机关接受控告并立案侦查，将产生一系列法律后果，包括犯罪嫌疑人的逮捕、起诉、审判等。控告书的提交是启动刑事诉讼程序的重要一步，对犯罪嫌疑人具有直接的约束力。

总结与建议：

• 在选择使用问责申请书还是控告书时，应首先明确自己的诉求和目的。如果主要是要求责任主体承担责任、赔偿损失或采取补救措施，且责任主体并非犯罪嫌疑人，则应选择问责申请书；如果主要是揭发、控诉某人或某组织的犯罪行为，并要求司法机关依法追究其刑事责任，则应选择控告书。
• 在撰写这两种法律文书时，都应确保内容真实、准确、完整，并附上相关证据材料以支持自己的诉求。同时，也应注意文书的格式和语言规范，以提高其法律效力和说服力。

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