关于客车载货发生事故保险公司是否会拒赔的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要综合考虑多个因素，包括法律规定、保险合同的具体约定以及事故发生的具体情况。以下是对此问题的详细分析：
一、保险合同的具体约定
免责条款：
- 大多数机动车商业保险合同中，都会包含关于车辆违规载货（包括超载）的免责条款。这些条款通常规定，如果车辆因违规载货导致事故，保险公司将不承担赔偿责任。
- 投保人在签订保险合同时，应仔细阅读合同条款，特别是免责条款部分，确保了解保险公司的赔偿范围和免责情况。如果合同中有明确的违规载货免责条款，并且保险公司已就该条款向投保人进行了提示和说明，那么当客车因违规载货发生事故时，保险公司有权依据该条款拒绝赔偿。
赔偿范围限制：
- 即使保险合同中没有明确的违规载货免责条款，但根据保险行业的示范条款或相关规定，违规载货导致的损失和费用增加部分，保险公司也可能不负责赔偿。例如，因违规载货导致事故发生的，交强险虽会赔偿人身伤亡和财产损失，但商业险可能仅按一定比例赔付或拒赔超出交强险限额的部分。
二、法律规定与司法实践
法律规定：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规，机动车载货应当符合核定的载质量，严禁违规载货。违规载货行为不仅违反了法律规定，也增加了事故发生的风险。
司法实践：
- 在司法实践中，法院会根据具体案情判断保险公司的拒赔理由是否成立。如果保险公司能够证明事故是由违规载货直接导致的，并且已在保险合同中明确告知了相关免责条款，那么法院可能会支持保险公司的拒赔请求。
- 反之，如果保险公司未能充分举证或免责条款无效（例如，保险公司未履行免责条款的说明义务），则可能需要承担赔偿责任。
三、特殊情况下的赔偿
交强险的赔偿：
- 无论客车是否违规载货，交强险都会在责任限额内对受害人的人身伤亡和财产损失进行赔偿。这是交强险的基本功能和社会责任的体现。
商业险的有限赔偿：
- 在某些情况下，即使客车违规载货，商业险也可能对部分损失进行赔偿。例如，如果事故并非完全由违规载货引起，或者违规载货只是事故的一个次要因素，那么保险公司可能会根据实际情况进行部分赔偿。但这需要具体的案件分析和法院的判决来确定。
四、实际操作建议
- 遵守交通法规：客车司机应严格遵守交通法规，避免违规载货行为，以降低事故风险和理赔纠纷的可能性。
- 仔细阅读保险合同：投保人在签订保险合同时，应仔细阅读合同条款，特别是免责条款部分，确保了解保险公司的赔偿范围和免责情况。
- 及时沟通与协商：在发生事故后，被保险人应及时与保险公司沟通，提供必要的事故证明和资料，以便保险公司进行理赔审核。如果发生争议，可以通过协商、仲裁或诉讼等方式解决。
综上所述，客车载货发生事故时保险公司是否会拒赔，取决于多个因素的综合考虑。投保人应充分了解合同条款和法律规定，遵守交通法规，以维护自身权益并降低风险。