公司在有纠纷时确实可以变更法人，但必须严格遵循法律程序和规定，且不能逃避公司应承担的法律责任。以下从多个角度为您详细分析：
一、法律依据与原则
根据《中华人民共和国公司法》第十三条：“公司法定代表人依照公司章程的规定，由董事长、执行董事或者经理担任，并依法登记。公司法定代表人变更，应当办理变更登记。” 这表明，法律并未禁止在有纠纷期间变更法人。同时，公司作为独立的民事主体，其债务和纠纷责任不因法人变更而改变，新法人需承接原公司的法律责任和义务。
二、变更程序与要求
内部决策程序：
- 变更法人需首先通过股东会或董事会的决议，确保变更的合法性和有效性。决议内容应符合公司章程和法律的要求。
准备并提交材料：
- 向公司登记机关提交包括变更登记申请书、新法人代表的身份证明、免职及任职文件等相关材料。这些材料需真实、完整，并符合登记机关的要求。
办理变更登记：
- 登记机关将对提交的材料进行审查，审查通过后，将换发新的营业执照，标志着法人变更登记的完成。
三、重要注意事项与潜在风险
法律责任承担：
- 公司作为独立的民事主体，其之前的债务和纠纷责任不因法人变更而改变。新法人需明确知晓并承担这些责任，避免后续纠纷。
- 若公司为逃避法律责任而恶意变更法人，可能面临法律风险，如被追究原法人的责任或受到行政处罚。
债权人权益保护：
- 恶意变更法人以逃避债务将损害债权人利益。债权人有权采取法律措施维护自身权益，包括申请撤销法人变更行为（若符合可撤销的法定情形）和要求原法人与新法人承担相应责任。
纠纷解决程序中的报备：
- 在涉及诉讼等纠纷解决程序中变更法人时，应及时向相关司法机关报备。未及时报备可能影响案件的正常审理和执行程序，如司法文书的送达等。
特殊情形下的限制：
- 若公司被列入失信被执行人名单，根据相关规定，企业法定代表人变更时需经过法院审查同意。这是为了防止企业通过变更法人来规避执行措施。
四、实际操作建议
确保变更程序的合法性：
- 严格按照法律程序进行法人变更，确保所有步骤都符合法律规定，避免因程序瑕疵导致变更无效。
妥善处理债务和纠纷：
- 在变更法人前，应对公司的债务和纠纷进行全面梳理，确保新法人知晓并愿意承担这些责任。同时，与债权人进行充分沟通，避免产生不必要的纠纷。
及时报备和更新信息：
- 在涉及诉讼等纠纷解决程序中变更法人时，及时向相关司法机关报备，并更新公司相关信息，确保诉讼程序的顺利进行。
公司在有纠纷时变更法人是一个复杂且敏感的过程，必须严格遵守相关法律法规和程序要求。如果您在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。