核心结论：甲方占用乙方土地，双方协商可从明确占用事实、确定补偿方案、约定归还期限与方式、签订书面协议这几个关键方面入手，以下为你详细阐述。

1. 明确占用事实
   • 收集证据：乙方要收集能证明甲方占用土地的证据，比如土地权属证书，像土地使用证、房产证等，这些能清晰表明乙方对土地拥有合法权利；还有现场照片、视频，能直观呈现甲方占用土地的现状，包括占用的范围、建筑或设施情况等；若有证人，如周边邻居、村委会成员等，他们的证言也能辅助证明占用事实。
   • 沟通确认：乙方可以主动与甲方沟通，以平和理性的态度指出甲方占用土地这一情况，要求甲方承认占用事实。在沟通中，乙方要做好记录，比如录音或者记录沟通要点，以备后续协商或可能的法律程序使用。
2. 确定补偿方案
   • 评估损失：乙方需要评估因甲方占用土地给自己造成的损失。这包括直接损失，如土地原本可用于出租获取的租金收益、用于农业种植的农作物收益等；还包括间接损失，例如因土地被占用导致乙方原本规划的项目无法实施而产生的预期利益损失等。如果损失评估较为复杂，乙方可以委托专业的评估机构进行评估。
   • 协商补偿方式：双方可以协商补偿方式，常见的有金钱补偿，即甲方按照评估的损失金额向乙方支付相应的款项；也可以是实物补偿，比如甲方提供与被占用土地价值相当的其他土地给乙方使用；还可以是混合补偿，即部分金钱部分实物。在协商补偿金额时，要充分考虑市场行情、土地的实际价值以及乙方的实际损失等因素。
3. 约定归还期限与方式
   • 归还期限：双方应明确约定甲方归还土地的具体期限。这个期限要根据实际情况合理确定，既要给甲方足够的时间处理占用土地上的相关事宜，如拆除建筑物、迁移设施等，又要保障乙方的合法权益尽快得到恢复。例如，如果占用土地上只是搭建了一些简易临时建筑，归还期限可以相对较短；如果涉及大型建筑物或复杂的设施，归还期限可能需要适当延长。
   • 归还方式：归还方式要具体明确，包括甲方归还土地时的状态，如是否需要恢复土地原状，若需要恢复，恢复到什么程度等。比如，如果土地原本是平整的耕地，甲方占用后进行了硬化处理，那么归还时甲方应负责将土地恢复至可耕种的状态。
4. 签订书面协议
   • 协议内容：双方协商一致后，一定要签订书面协议。协议内容应包括双方的基本信息、占用土地的具体位置、面积、占用事实的确认、补偿方案、归还期限与方式、违约责任等条款。违约责任条款要明确，如果甲方未按照协议约定归还土地或支付补偿款，应承担怎样的法律责任，如支付违约金、赔偿乙方因此遭受的额外损失等。
   • 协议效力：签订书面协议后，双方应按照协议约定履行各自的义务。协议具有法律效力，如果一方不履行协议，另一方可以依据协议向法院提起诉讼，要求对方承担相应的法律责任。

在协商过程中，双方都要保持冷静和理性，以解决问题为导向，通过友好协商达成互利共赢的方案。如果协商过程中出现分歧无法解决，也可以寻求第三方调解机构的帮助，如当地的人民调解委员会等。