合同只盖法人章，在大多数情况下是有效的，但具体效力还需结合合同内容、当事人约定以及相关法律法规来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法人章的法定效力
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。法人章作为公司对外意思表示的重要凭证，具有代表公司的法定效力。因此，合同上加盖法人章，通常视为公司对合同内容的认可和承诺，合同依法成立并生效。
二、合同有效的情况
符合交易习惯或授权：
- 在商业实践中，如果双方根据交易习惯或以往合作模式，认可仅加盖法人章即可使合同生效，那么此类合同有效。
- 若公司内部有明确规定，授权特定人员使用法人章签订合同，则此类合同同样有效，无需额外签字。
履行治愈规则：
- 在签名、盖章或按指印之前，如一方已履行主要义务且对方接受，该合同也被视为已成立。这意味着，即使合同形式上存在瑕疵，如仅加盖法人章而未签字，但实际履行已经弥补了形式上的不足，合同仍然有效。
三、合同可能无效或效力待定的情况
法人章被伪造或盗用：
- 如果法人章被他人伪造或盗用后加盖在合同上，且公司对此并不知情且未追认，则该合同可能无效。因为此时的盖章行为并非公司的真实意思表示。
存在法定无效事由：
- 合同内容若违反法律法规的强制性规定，或存在恶意串通、损害国家、集体或第三人利益等法定无效情形，即使加盖了法人章，合同也无效。
合同约定特别生效条件：
- 当事人在合同中特别约定了合同必须在签字并加盖法人章后才生效的情况下，仅有法人章而没有其他必要签字的合同不会生效。这是尊重当事人意思自治的体现，也是合同自由原则的具体应用。
四、法律建议
明确合同生效条件：
- 在签订合同时，双方应明确约定合同的生效条件，包括是否需要签字、盖章或按指印等。这有助于避免后续因合同效力问题产生的纠纷。
核实法人章的真实性：
- 在签订合同时，应仔细核实法人章的真实性，可以通过比对样本、查询公司注册信息等方式进行验证。这有助于防止因法人章伪造或盗用而导致的合同无效风险。
完善合同形式：
- 为了确保合同的合法性和有效性，建议在商业活动中，除了加盖法人章外，也可以同时要求法定代表人或授权代表签字。这有助于增强合同的证据效力，降低纠纷风险。
及时咨询法律专业人士：
- 若因合同效力问题产生纠纷或疑问，建议及时向我咨询，以获取准确的法律意见和解决方案。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供针对性的法律建议。
综上所述，合同只盖法人章在大多数情况下是有效的，但具体效力还需结合合同内容、当事人约定以及相关法律法规来综合判断。在签订合同时，双方应明确约定合同的生效条件，并仔细核实相关信息的真实性，以确保合同的合法性和有效性。