当您遇到“旷工一天扣三天工资”的情况时，这通常是不合法的，我们可以从法律依据、合理性以及应对措施三个方面来详细分析这个问题。
一、法律依据层面
《劳动法》相关规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠。这意味着，用人单位在支付工资时，必须遵循法定标准和约定条件，不能随意扣除。
《工资支付暂行规定》要求：
- 《工资支付暂行规定》第十六条明确指出，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求赔偿，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。旷工一天扣三天工资的做法，显然超出了这个法定范围。
二、合理性层面
不符合公平原则：
- 劳动者旷工一天，其损失主要是当天的劳动产出和可能对工作安排造成的影响。扣除三天的工资远远超过了其实际造成的损失，这对劳动者来说是不公平的。
不利于劳动关系稳定：
- 这种不合理的扣款规定容易引发劳动者的不满和抵触情绪，导致劳动关系紧张，甚至可能引发劳动争议和法律纠纷，对用人单位的长期发展也是不利的。
三、应对措施
核查公司规章制度与合同：
- 首先，您需要确认公司的规章制度是否经过民主程序制定并公示，以及劳动合同中是否明确约定了旷工扣款规则。如果规章制度未经公示或劳动合同中无相关约定，则用人单位无权单方扣款。
与公司协商沟通：
- 您可以以书面形式向公司提出异议，引用具体法律条款说明扣款的违法性，并要求公司提供扣款依据。同时，您可以建议公司按实际缺勤天数扣款，或通过补班、绩效扣分等方式替代罚款。
寻求外部帮助：
- 如果与公司协商无果，您可以向当地人力资源和社会保障局劳动监察部门提交书面投诉材料，附上相关证据（如工资条、考勤记录、制度文件等）。
- 您还可以申请劳动仲裁，准备仲裁申请书、身份证明、劳动关系证明及扣款凭证等材料，主张返还违法扣款及支付经济补偿金（若因此解除劳动合同）。
- 对仲裁结果不服的，您还可以在15日内向法院提起诉讼，提供新证据支持诉求。
保留关键证据：
- 在处理此类问题时，保留关键证据至关重要。您需要保存劳动合同、工资单、考勤记录原件，收集制度培训签到表、电子邮件通知等公示证明，并记录协商过程（录音需征得对方同意）。
后续预防措施：
- 为了避免类似情况再次发生，您可以在签订劳动合同时仔细审阅扣款相关条款，拒绝签署空白合同。
- 同时，定期查阅公司公告栏或内部系统，及时获取制度修订信息，并参加劳动法规培训，提升自我保护能力。
综上所述，“旷工一天扣三天工资”的做法通常是不合法的。面对这种情况，您应首先核查公司规章制度与合同，与公司协商沟通；若协商无果，则寻求外部帮助并保留关键证据；最后，采取后续预防措施以避免类似情况再次发生。