结论：劳动法中并未直接规定12小时两班倒的工作制度是否合法，但根据相关法律法规，可以明确的是，如果这种工作制度违反了工时限制、休息休假规定或未支付相应的加班费，则是不合法的。
分析说明：
工时限制：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。虽然该法第三十九条也规定了企业因生产特点不能实行上述工时制度的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法，但这并不意味着可以无限制地延长工作时间。
- 如果12小时两班倒的工作制度导致劳动者每日工作时间超过八小时，且未经劳动行政部门批准实行特殊工时制度，那么这种工作制度就违反了工时限制，是不合法的。
休息休假规定：
- 《中华人民共和国劳动法》第三十八条规定，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。如果12小时两班倒的工作制度导致劳动者无法享受每周至少一天的休息日，那么这种工作制度就违反了休息休假规定，同样是不合法的。
加班费支付：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
- 如果12小时两班倒的工作制度导致劳动者需要加班，但用人单位未按照上述标准支付加班费，那么这种工作制度在加班费支付方面也是不合法的。
特殊场景：
- 在某些特殊行业或岗位，如医疗、交通、能源等，由于工作性质的特殊性，可能需要实行轮班制或特殊工时制度。但即使在这种情况下，用人单位也必须遵守相关法律法规的规定，确保劳动者的合法权益不受侵害。例如，需要经过劳动行政部门的批准，并确保劳动者的休息休假权利得到保障。
行动建议：
- 如果你或你身边的人正在遭受12小时两班倒这种可能违法的工作制度，建议首先与用人单位进行沟通协商，要求调整工作制度或支付相应的加班费。
- 如果沟通协商无果，可以向当地的劳动行政部门投诉举报，寻求行政部门的帮助和支持。
- 必要时，也可以寻求法律援助或提起劳动仲裁、诉讼等法律程序来维护自己的合法权益。
法律背景：
- 劳动法旨在保护劳动者的合法权益，调整劳动关系，建立和维护适应社会主义市场经济的劳动制度。因此，任何违反劳动法规定的工作制度都是不合法的，劳动者有权拒绝并寻求法律保护。
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