公司辞退旷工员工的合法程序主要包括以下几个步骤：
确认旷工事实：
- 公司需要确保员工确实存在旷工行为，这通常通过考勤记录、工作安排记录、同事证言等证据来证实。旷工的定义一般是员工未经公司批准，无正当理由未到岗工作。
遵循公司规章制度：
- 公司应依据其内部规章制度来处理旷工问题。这些规章制度应当明确规定旷工的定义、处理程序、处罚措施等，并且这些规定需要符合法律法规的要求，不能侵犯员工的合法权益。
- 在处理旷工员工时，公司应确保已经向员工明确告知了相关规章制度，并且员工已经签字确认知晓。
发出书面警告或通知：
- 在确认旷工事实后，公司应向员工发出书面警告或通知，明确指出其旷工行为、违反的规章制度条款以及可能面临的后果。
- 警告或通知应要求员工在一定期限内（如3天、7天等）返回工作岗位或提供合理的旷工理由。
听取员工陈述和申辩：
- 在作出辞退决定前，公司应给予员工陈述和申辩的机会。员工可以就旷工行为提出合理的解释或辩解，公司应认真听取并考虑。
作出辞退决定并通知员工：
- 如果员工在规定期限内未返回工作岗位或未提供合理的旷工理由，且公司认为其旷工行为严重违反了规章制度，公司可以作出辞退决定。
- 辞退决定应以书面形式通知员工，并明确辞退的原因、依据以及生效日期。
办理离职手续：
- 辞退决定生效后，公司应协助员工办理离职手续，包括结算工资、经济补偿（如适用）、转移社保关系等。
- 公司应确保离职手续的办理符合法律法规的要求，避免引发不必要的劳动纠纷。
法律建议与注意事项：
- 合法性审查：在辞退旷工员工前，公司应确保其处理程序符合法律法规的要求，特别是《劳动合同法》等相关规定。避免因程序不合法而引发劳动纠纷或承担法律责任。
- 证据保留：公司应妥善保留与旷工员工处理相关的所有证据，包括考勤记录、警告通知、员工陈述和申辩材料等。这些证据在后续可能发生的劳动纠纷中具有重要的证明作用。
- 沟通协商：在处理旷工员工时，公司应尽量与员工进行沟通协商，了解其旷工的原因和背景，寻求双方都能接受的解决方案。这有助于减少劳动纠纷的发生，维护公司的良好形象。
可能面临的法律后果：
- 如果公司未按照合法程序辞退旷工员工，员工可能会向劳动仲裁机构或法院提起劳动仲裁或诉讼，要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金等。
- 如果公司的规章制度存在违法内容或未向员工明确告知，相关规章制度可能被认定为无效，公司因此可能面临法律责任。
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