结论：加班工资以最低工资标准为基数是否合法，需分情况讨论，不能一概而论。具体分析如下：

1. 若劳动合同或集体合同中明确约定加班工资计算基数，且该基数不低于最低工资标准，则合法
   根据《工资支付暂行规定》第十三条，加班工资计算基数应优先遵循劳动合同或集体合同的约定。若合同中明确约定以“基本工资”“岗位工资”等具体数额为基数，且该数额不低于当地最低工资标准，则用人单位以此为基数计算加班工资符合法律规定。
   例如：某地最低工资为2000元/月，劳动合同约定加班基数为2500元/月，则用人单位按2500元计算加班工资合法。

2. 若劳动合同未约定或约定不明确，则加班工资基数应按劳动者正常工作时间工资确定，此时以最低工资为基数可能违法
   根据《劳动合同法》及相关司法解释，若合同未约定加班基数，则应以劳动者“正常工作时间工资”（即劳动合同约定的工资，不含加班费、奖金等）为基数。若劳动者实际工资高于最低工资，用人单位却以最低工资为基数计算加班工资，则属于违法克扣工资。
   例如：劳动者月工资为5000元（含基本工资3000元+绩效2000元），但用人单位以最低工资2000元为基数计算加班工资，则违法。

3. 特殊情形：部分地区规定加班基数“下限”为最低工资
   少数地区（如部分省份）的地方性法规可能规定，若劳动合同未约定加班基数，且劳动者无法证明“正常工作时间工资”具体数额，则以最低工资为基数计算加班工资。但此类规定需严格符合地方立法程序，且不能排除劳动者主张实际工资的权利。
   例如：某省规定“未约定加班基数的，以最低工资为基数，但劳动者有证据证明实际工资更高的除外”。

建议：

• 劳动者可先核查劳动合同、工资条等证据，确认是否约定加班基数及自身实际工资水平；
  
• 若用人单位以最低工资为基数且明显低于实际工资，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求补足差额；
  
• 用人单位应完善合同条款，明确加班基数计算方式，避免纠纷。
  

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