结论：在存在遗赠扶养协议且户主不是本人的情况下，房产确权证的归属并非单纯由户主或遗赠扶养协议单独决定，而是需要综合考虑遗赠扶养协议的内容、房产的登记情况、实际占有使用情况以及相关法律法规的规定。
分析说明：
遗赠扶养协议的法律效力：
- 遗赠扶养协议是遗赠人和扶养人之间关于扶养人承担遗赠人生养死葬的义务，遗赠人将其财产遗赠给扶养人的协议。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，遗赠扶养协议具有法律效力，双方应按照协议履行各自的义务。
- 如果遗赠扶养协议中明确约定了房产的归属，且该协议合法有效，那么房产的归属应按照协议执行。
房产登记情况的影响：
- 房产确权证，即房产证，是证明房产归属的重要法律文件。根据《中华人民共和国民法典》物权编的规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。
- 如果房产证上登记的是遗赠人的名字，且遗赠扶养协议中未明确约定房产在遗赠人去世后的归属，或者约定与房产证登记情况相冲突，那么房产的归属可能会产生争议。此时，需要依据遗赠扶养协议的内容、双方的实际履行情况以及相关法律法规进行综合判断。
实际占有使用情况：
- 在某些情况下，即使房产证上登记的不是扶养人的名字，但如果扶养人实际占有并使用了该房产，且这种占有和使用是基于遗赠扶养协议的约定或遗赠人的明确表示，那么在实际操作中，扶养人可能会主张对房产的权益。
- 然而，这种主张是否成立，还需要根据具体情况和相关法律法规进行判断。如果遗赠扶养协议中未明确约定房产的占有和使用权，或者约定不明确，那么扶养人的主张可能会受到一定的限制。
相关法律法规的适用：
- 在处理此类纠纷时，除了考虑遗赠扶养协议和房产证登记情况外，还需要适用相关法律法规的规定。例如，《中华人民共和国民法典》中关于遗赠扶养协议、物权变动、继承等方面的规定。
- 如果双方无法就房产的归属达成一致意见，可以通过诉讼途径解决纠纷。法院在审理此类案件时，会综合考虑遗赠扶养协议的内容、房产的登记情况、实际占有使用情况以及相关法律法规的规定，作出公正的判决。
建议与行动：
- 审查遗赠扶养协议：首先，应仔细审查遗赠扶养协议的内容，特别是关于房产归属的约定。如果协议中明确约定了房产的归属，且该协议合法有效，那么应按照协议执行。
- 咨询专业律师：如果遗赠扶养协议中未明确约定房产的归属，或者约定与房产证登记情况相冲突，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据具体情况和相关法律法规，为你提供合理的解决方案。
- 考虑诉讼途径：如果双方无法就房产的归属达成一致意见，且协商无果，可以考虑通过诉讼途径解决纠纷。在诉讼过程中，应提供充分的证据证明自己的主张，并遵循法院的判决。
后续思考依据：
- 在处理此类纠纷时，应充分考虑遗赠扶养协议的法律效力、房产的登记情况、实际占有使用情况以及相关法律法规的规定。这些因素将直接影响房产的归属和纠纷的解决方式。
- 如果遗赠扶养协议中存在模糊或不明确的地方，应及时与对方进行沟通协商，以明确各自的权利和义务。如果协商无果，应及时寻求法律帮助以维护自己的合法权益。