施工单位威胁工程验收人员属于违法行为，应当立即采取法律手段保护自身权益，具体处理方式如下：

1. 固定证据
   首先需保留所有能证明威胁行为的证据，包括但不限于：

   • 书面威胁材料（如短信、邮件、书面函件）；
     
   • 录音、录像（需确保合法性，如公开场合录制或对方知情）；
     
   • 证人证言（如在场同事、其他验收人员）；
     
   • 医疗记录（若威胁导致身体伤害或精神损害）。
     法律依据：根据《民事诉讼法》第六十六条，证据需真实、合法且与案件关联，固定证据是后续维权的基础。

2. 立即报警
   若威胁涉及人身安全（如言语恐吓、肢体冲突、跟踪等），应第一时间向公安机关报案，要求立案调查。

   • 公安机关可依据《治安管理处罚法》第四十二条对威胁者处以拘留或罚款；
     
   • 若威胁行为升级为暴力或限制人身自由，可能构成《刑法》中的“寻衅滋事罪”或“非法拘禁罪”，需追究刑事责任。
     操作建议：报案时提交证据材料，并要求公安机关出具《受案回执》。

3. 向建设单位或监管部门投诉

   • 若施工单位受雇于建设单位，可向建设单位书面投诉，要求其制止威胁行为并更换施工单位；
     
   • 若涉及公共项目（如政府工程），可向当地住建部门、质监站或纪委监委举报，要求介入调查并处罚违规单位。
     法律依据：根据《建筑法》第六十三条，建设单位需对施工单位行为负责，监管部门有权对违规行为责令整改或停工。

4. 申请人身安全保护令（如威胁持续）
   若威胁持续存在且公安机关未及时处理，可向法院申请人身安全保护令，禁止施工单位接近或骚扰验收人员。
   适用条件：需证明存在现实危险（如多次威胁、携带凶器等）；
   法律依据：根据《反家庭暴力法》第二十七条（虽针对家庭暴力，但实践中可扩展至职场威胁）。

5. 提起民事诉讼索赔
   若威胁导致人身伤害或财产损失（如精神损害、误工费等），可向法院起诉施工单位，要求赔偿损失。
   赔偿范围：包括医疗费、精神损害抚慰金、律师费等；
   法律依据：根据《民法典》第一千一百六十五条，过错方需承担侵权责任。

预防建议：

• 验收时建议多人同行，避免单独与施工单位接触；
  
• 提前告知建设单位或监管部门验收计划，形成监督；
  
• 对存在违规记录的施工单位，可要求其签署《合规承诺书》。
  

如有进一步细节（如威胁方式、是否涉及黑恶势力等），可向我补充说明，我会结合具体情形提供更精准的建议。