事业单位合同工转正后和有正式编制人员的退休待遇通常是不一样的。以下从几个方面进行详细分析：
一、编制性质与退休待遇的关联
编制性质：
- 正式编制人员：通常享有国家财政全额拨款或差额拨款的待遇，其工资、福利、退休金等均由国家或单位按照相关规定进行保障。
- 合同工（包括转正后的合同工）：虽然可能享受与正式编制人员相似的工资待遇，但在退休金的计算、发放等方面，往往受到合同条款、单位政策以及地方规定等多种因素的影响。
退休待遇差异：
- 正式编制人员的退休金通常按照其在职时的工资水平、工龄、职称等因素进行计算，且往往有较高的替代率（即退休金占在职时工资的比例）。
- 合同工的退休金则可能受到合同期限、缴费基数、缴费年限等多种因素的制约，其替代率可能相对较低。
二、具体影响因素
社保缴纳：
- 正式编制人员：通常按照较高的基数和比例缴纳社会保险，包括养老保险、医疗保险等，这为其退休后的生活提供了较好的保障。
- 合同工：其社保缴纳基数和比例可能因单位政策、个人工资水平等因素而有所不同，从而影响其退休后的待遇。
单位政策：
- 不同的事业单位对于合同工和正式编制人员的退休待遇可能有不同的政策规定。一些单位可能为了吸引和留住人才，对合同工提供较为优厚的退休待遇；而另一些单位则可能严格执行国家相关规定，导致合同工的退休待遇相对较低。
地方规定：
- 不同地区对于事业单位人员的退休待遇可能有不同的地方性规定。这些规定可能涉及退休金的计算方法、发放标准、调整机制等方面，从而影响合同工和正式编制人员的退休待遇差异。
三、建议与注意事项
了解单位政策：
- 合同工在考虑转正或继续留在单位工作时，应充分了解单位的退休待遇政策，包括退休金的计算方法、发放标准等，以便做出明智的决策。
关注社保缴纳：
- 合同工应关注自己的社保缴纳情况，确保单位按照相关规定为自己缴纳社会保险，以保障自己退休后的生活。
咨询专业人士：
- 如果对退休待遇有疑问或需要进一步的了解，建议咨询单位的人事部门或专业的社保机构，以获取准确的信息和建议。
保留相关证据：
- 在工作过程中，合同工应保留好与退休待遇相关的证据，如工资单、社保缴纳记录等，以便在需要时维护自己的合法权益。
总结来说，事业单位合同工转正后和有正式编制人员的退休待遇通常是不一样的，这主要受到编制性质、社保缴纳、单位政策以及地方规定等多种因素的影响。因此，合同工在考虑转正或继续留在单位工作时，应充分了解这些因素，并做出明智的决策。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。