关于劳动合同主体变更两年后是否有补偿的问题，这主要取决于变更的具体情形和法律规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 用人单位发生合并或分立：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十四条，用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。在此情形下，劳动合同的履行主体虽然发生变化，但合同内容未改变，且劳动者的权益得到保障，因此通常不涉及经济补偿。

2. 用人单位主体名称变更：

   • 如果用人单位仅变更名称、法定代表人、主要负责人或投资人等事项，这并不影响劳动合同的履行。此时，劳动合同的主体并未实质性变更，劳动者不会因此获得经济补偿。

3. 协商一致的主体变更：

   • 经用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括用人单位的主体。若双方就主体变更达成一致，并明确约定了经济补偿事宜，则劳动者有权按照约定获得补偿。然而，在缺乏明确约定的情况下，单纯的主体变更并不直接触发经济补偿义务。

4. 因经营需要导致的主体变更（非法定情形）：

   • 若用人单位因经营需要调整组织架构，将劳动者安排至关联公司工作，但未依法办理劳动关系转移手续，可能构成对原劳动合同的违反。此类情形下，劳动者可主张解除劳动关系并要求经济补偿。但需注意，此处的补偿依据是用人单位的违法行为，而非主体变更本身。

5. 公司注销或破产清算：

   • 当用人单位被依法宣告破产、吊销营业执照、责令关闭、撤销或决定提前解散时，劳动合同终止。根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。经济补偿的计算标准按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

针对您的情况，如果劳动合同主体变更已经两年，且没有上述特定情形（如用人单位违法、破产清算等）发生，那么通常不会因为单纯的主体变更而获得经济补偿。然而，如果变更过程中存在违法行为或未按照法律规定履行相关手续，您仍有权主张自己的合法权益。

建议：

• 如果您对劳动合同主体变更的具体情况有疑问或认为自己的权益受到侵害，建议收集相关证据（如劳动合同、变更协议、工资单等）。
• 您可以进一步向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和帮助。

希望以上分析能对您有所帮助。如果您有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。