结论：被告行政决定书涉及两个决定，立案庭收了两个案件，但答辩状只有一个，这一程序是否合法不能一概而论，需根据具体情况判断。

分析：

1. 程序合法性的基本原则：

   • 在行政诉讼中，每个案件都应当独立进行审理，包括独立的立案、送达、答辩、开庭等程序。这是为了确保每个案件都能得到公正、独立的审查。

2. 答辩状数量与案件数量的关系：

   • 通常情况下，如果立案庭收了两个案件，那么被告应当针对每个案件分别提交答辩状。这是因为每个案件都有其独立的诉讼请求和事实依据，需要被告分别进行答辩。
   • 然而，也存在一些特殊情况。例如，如果两个案件是基于相同的事实和法律依据提出的，且被告的答辩内容完全相同，那么被告可能会选择提交一份综合性的答辩状，并在答辩状中明确说明该答辩状同时适用于两个案件。这种情况下，虽然答辩状只有一份，但程序上并不一定违法，关键在于是否满足了法院对答辩的要求以及是否保障了原告的诉讼权利。

3. 法院对答辩状的审查：

   • 法院在收到答辩状后，会对其进行审查。如果法院认为答辩状不符合要求，比如未针对每个案件分别答辩，或者答辩内容不充分、不明确等，法院可能会要求被告补充或修改答辩状。
   • 如果被告未按照法院的要求进行补充或修改，或者法院认为被告的答辩行为影响了案件的公正审理，那么法院可能会对被告作出相应的处理，比如视为被告未答辩、对被告进行罚款等。

4. 建议：

   • 对于原告而言，如果发现被告只提交了一份答辩状而涉及两个案件，可以向法院提出异议，要求被告分别提交答辩状或者对答辩状进行补充说明。
   • 对于被告而言，为了避免程序上的瑕疵和可能的法律后果，最好还是针对每个案件分别提交答辩状，确保每个案件都能得到独立、公正的审理。

后续行动建议：

• 如果您是原告，且对被告的答辩状数量有异议，可以向法院提出书面异议，并附上相关证据和法律依据。
• 如果您是被告，且确实因为特殊原因只能提交一份答辩状，建议在答辩状中明确说明该答辩状同时适用于两个案件，并附上相关证据和法律依据以支持您的观点。同时，也要做好法院可能要求您补充或修改答辩状的准备。

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