当机动车与电瓶车在交通事故中负有同等责任，也就是我们通常所说的“五五责任”时，关于修车赔偿的问题，可以按照以下步骤来处理：
一、事故现场处理
立即报警并救治伤员：
- 事故发生后，首要任务是确保人员安全。请立即拨打110报警，让交警来现场勘查并出具交通事故责任认定书。
- 如果有人员受伤，务必第一时间拨打120急救电话，确保伤者得到及时救治。
保护现场与收集证据：
- 在等待交警到来的过程中，请保护好事故现场，不要随意移动车辆或破坏现场证据。
- 如果因为抢救伤员需要移动车辆，请务必标明位置或拍摄照片记录，以便后续处理。
二、保险赔偿流程
交强险先行赔付：
- 根据相关法律法规，机动车的交强险需要在责任限额内先行赔付，而且不区分责任比例。
- 交强险的财产损失赔偿限额通常是2000元。如果电瓶车的损失在这个限额内，那么将由机动车的交强险全额赔偿。
- 如果事故中有人员受伤，医疗费用将先由对方的交强险赔付1万元（在医疗费用赔偿限额内），超出部分再按照责任比例分担。
商业保险补充赔偿：
- 如果交强险的赔偿不足以覆盖电瓶车的损失或人伤费用，且机动车购买了商业第三者责任险，那么剩余部分将由保险公司根据保险合同和事故责任比例进行补充赔偿。
- 如果商业险的保额不足或者机动车没有购买商业险，那么剩余的损失将由机动车驾驶人自行承担。
三、修车赔偿的具体操作
确定损失金额：
- 电瓶车的维修费用需要由专业的维修机构进行评估，并出具维修发票或费用清单。
- 同样，如果机动车也有损坏，也需要进行维修评估并保留相关证据。
协商赔偿：
- 在确定了双方的损失金额后，根据五五责任的原则，双方各承担50%的损失。
- 例如，如果电瓶车的维修费用是2000元，机动车的维修费用是1000元，那么机动车驾驶人需要赔偿电瓶车车主1000元（2000元的50%），同时电瓶车车主也需要赔偿机动车驾驶人500元（1000元的50%）。在实际操作中，双方可以协商互相抵消部分赔偿金额。
法律途径解决：
- 如果双方无法就赔偿金额达成一致，可以寻求法律援助或向法院提起民事诉讼。
- 在诉讼过程中，需要提供充分证据支持自己的主张，如事故责任认定书、维修发票、医疗费用清单等。
四、注意事项
保留所有证据：
- 在整个处理过程中，请务必保留好所有与事故相关的证据，以便后续处理或诉讼使用。
及时申请复核：
- 如果对交警队出具的事故责任认定书有异议，可以在规定时间内向上级交警部门申请复核。
积极配合理赔：
- 如果涉及保险赔偿，请按照保险公司的要求提供完整的理赔资料，并积极配合保险公司进行理赔流程。
综上所述，当机动车与电瓶车在交通事故中负五五责任时，修车赔偿的问题可以通过交强险先行赔付、商业保险补充赔偿以及双方协商或法律途径解决。在整个过程中，请保持冷静理性，遵循法律法规，确保事故得到妥善解决。