核心结论：经济补偿金中12个月平均工资的计算，原则上应包含劳动者正常出勤情况下应得的工资，整月请假期间若属于非劳动者原因导致的缺勤（如医疗期、停工留产等法定情形），且用人单位依法支付了工资或生活费的，该期间工资应计入平均工资；若属于劳动者无故缺勤或请假未获批准的，该期间工资可能不计入或按实际发放金额计算。具体分情况说明如下：
1. 整月请假属于法定情形（如医疗期、停工留产等）
- 法律依据：根据《劳动合同法》第四十七条及《劳动合同法实施条例》第二十七条，经济补偿金的月工资是指劳动者在劳动合同解除或终止前12个月的平均工资，按劳动者应得工资计算，包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等货币性收入。若劳动者因法定情形（如患病、非因工负伤、女职工三期等）整月请假，且用人单位依法支付了病假工资、停工留产工资或生活费的，该期间工资应计入平均工资计算基数。
- 计算方式：
- 若请假期间工资未低于当地最低工资标准的80%（如病假工资），则按实际发放金额计入；
- 若请假期间未发放工资（如旷工），则该月可能不计入12个月周期（需结合具体请假原因和单位规章制度判断）。
2. 整月请假属于非法定情形（如事假、旷工等）
- 事假：若劳动者因个人原因申请事假且获批准，用人单位可不支付事假期间工资。此时，该月工资可能为0或仅包含未请假天数的工资，按实际发放金额计入平均工资。例如：劳动者月工资5000元，事假15天，实发工资2500元，则该月按2500元计入。
- 旷工：若劳动者无故缺勤且未获批准，用人单位可按规章制度扣发工资甚至解除合同。若该月工资被扣发至0或极低金额，按实际发放金额计入平均工资，但需注意用人单位规章制度是否合法（如扣发比例是否超过法定限度）。
3. 特殊情形：12个月周期内请假月数较多
- 若劳动者在12个月周期内多个月份存在请假，导致实际出勤月数不足12个月，仍需按12个月计算平均工资，但请假月份按实际发放工资计入。例如：劳动者请假3个月，实发工资分别为0、2000、5000元，其余9个月正常工资为5000元，则平均工资为：
[
\frac{(0 + 2000 + 5000) + 5000 \times 9}{12} = \frac{7000 + 45000}{12} \approx 4333.33 \text{元}
]
- 极端情况：若劳动者在12个月周期内全部请假且未获工资（如长期旷工），则可能因无正常工资记录导致经济补偿金计算基数极低或为0，但用人单位需证明劳动者存在过错（如严重违反规章制度）。
4. 注意事项
- 工资构成：计算平均工资时，需包含奖金、津贴、补贴等固定收入，但不包含非经常性收入（如年终奖金需按实际发放月份分摊）。
- 地方规定：部分地区（如上海）明确，病假工资不得低于最低工资标准的80%，且需计入经济补偿金基数；其他地区可能无特殊规定，需结合当地政策。
- 举证责任：劳动者需提供请假记录、工资条等证据证明请假原因及工资发放情况；用人单位需提供规章制度、考勤记录等证明扣发工资的合法性。
建议：若您涉及具体案件，建议整理劳动合同、工资条、请假单等材料，进一步分析请假性质、工资发放情况及地方规定，以确保经济补偿金计算合法合规。如有疑问，可直接向我咨询。