单位以发票报销形式发放工资通常不合法，但需分情况讨论，具体分析如下：

1. 合法性边界：工资与报销的本质区别
   根据《劳动法》《劳动合同法》及《个人所得税法》，工资是劳动者提供劳动的直接对价，需以货币形式按月支付，并依法代扣代缴个人所得税。而发票报销属于企业费用支出，需与实际经营业务相关（如差旅费、办公用品费等），且需符合财务制度及税务规定。
   核心区别：工资是劳动报酬，报销是成本补偿，二者性质、税务处理方式完全不同。若单位将工资拆分为“基本工资+发票报销”，实质是逃避个税缴纳义务，可能涉嫌违法。

2. 常见违法情形及风险

   • 偷逃个税：单位要求员工提供发票冲抵部分工资，减少应纳税所得额，属于《税收征收管理法》第六十三条规定的“偷税”行为，可能面临补缴税款、滞纳金及罚款（0.5倍至5倍税款）。
     
   • 违反劳动法：工资支付需符合劳动合同约定及最低工资标准，若报销部分导致实际工资低于法定标准，单位需承担补足差额及支付经济补偿金的责任。
     
   • 财务违规：虚假报销可能违反《会计法》第十四条“真实记录”原则，单位及直接责任人员可能被处以罚款（3000元至5万元），情节严重者构成犯罪。

3. 例外情形：合法报销的边界
   若单位发放的是与工作相关的补贴（如交通补贴、通讯补贴），且符合以下条件，则可能合法：

   • 补贴金额在当地税务部门规定的免税额度内（如部分地区允许每月500元以内的交通补贴免征个税）；
     
   • 补贴与实际工作需求直接相关（如外勤人员交通费）；
     
   • 单位已按“工资薪金所得”代扣代缴个税。
     关键点：此类补贴需纳入工资总额计算，而非通过发票报销形式发放。

4. 实务建议

   • 对劳动者：若单位要求提供发票冲抵工资，可要求单位出具书面说明并保留证据，向当地税务部门举报（12366热线）或申请劳动仲裁。
     
   • 对单位：应规范工资支付流程，避免将工资与报销混同。如需发放补贴，可咨询税务机关明确免税政策，或通过调整薪酬结构（如提高绩效工资比例）合法降低税负。

总结：单位以发票报销形式发放工资，若目的是逃避个税或降低用工成本，则违法风险极高。劳动者有权拒绝并维权，单位需承担行政甚至刑事责任。建议双方均遵守税法及劳动法规定，通过合法途径处理薪酬问题。