三层以下农村自建房施工主要适用的法律包括《中华人民共和国建筑法》、《村庄和集镇规划建设管理条例》以及地方性法规和规章。以下是对这些法律的详细解释和适用情况分析：

1. 《中华人民共和国建筑法》：

   • 适用性：虽然该法主要规范的是建筑工程活动，但其中的一些基本原则和规定，如建筑许可、建筑工程发包与承包、建筑工程监理等，对于农村自建房施工同样具有指导意义。特别是当自建房规模较大或涉及公共安全时，更应严格遵守该法的相关规定。
   • 重点条款：例如，该法第八条规定，申请领取施工许可证，应当具备一定条件，包括已经办理该建筑工程用地批准手续、在城市规划区的建筑工程已经取得规划许可证等。虽然农村自建房可能不涉及城市规划区，但办理用地批准手续是基本要求。

2. 《村庄和集镇规划建设管理条例》：

   • 适用性：该条例专门针对村庄和集镇的规划建设管理，对于农村自建房施工具有直接的规范作用。它规定了村庄和集镇规划的制定、实施和管理，以及建设工程的选址、设计、施工等各个环节的要求。
   • 重点条款：例如，该条例第十八条规定，农村村民在村庄、集镇规划区内建住宅的，应当先向村集体经济组织或者村民委员会提出建房申请，经审议同意后，按照下列程序办理：…（三）根据需要，申请用地批准手续；…。此外，该条例还规定了建设工程的质量和安全要求，以及违反规定的法律责任。

3. 地方性法规和规章：

   • 适用性：除了国家层面的法律外，各地还根据实际情况制定了地方性法规和规章，对农村自建房施工进行具体规范。这些地方性法规和规章可能涉及施工许可、工程质量监督、安全监管等方面的内容。
   • 重点内容：由于地方性法规和规章因地区而异，因此具体内容会有所不同。例如，某些地区可能要求农村自建房施工必须取得施工许可证，或者必须接受工程质量监督机构的监督等。

法律建议：

• 在进行三层以下农村自建房施工前，建议先了解并遵守当地的相关法律法规和规章，确保施工活动的合法性和安全性。
• 如果对法律条款或施工要求有疑问，可以咨询当地的建设行政主管部门或相关法律专业人士，以获取准确的指导和建议。
• 在施工过程中，应严格按照设计图纸和施工规范进行施工，确保工程质量和安全。如果发生纠纷或问题，应及时寻求法律途径解决。

可能法律后果：

• 如果违反相关法律法规和规章进行施工，可能会面临行政处罚，如罚款、责令停工等。
• 如果因施工质量问题导致人身伤害或财产损失，还可能承担民事赔偿责任，甚至刑事责任。

如有任何关于三层以下农村自建房施工的法律问题，可以直接向我咨询。