在保险合同中同时约定免赔额和免赔率时，处理方式需结合合同条款的具体约定以及相关法律规定，通常有两种处理逻辑：一是先计算免赔率再应用免赔额，二是先应用免赔额再计算免赔率，具体以合同约定为准；若合同未明确，则可能引发争议，需通过协商、仲裁或诉讼解决。以下是详细分析：

1. 合同有明确约定时，按约定处理
   若保险合同中明确约定了免赔额和免赔率的计算顺序（例如“先按免赔率计算免赔金额，再扣除免赔额”或“先扣除免赔额，再按剩余金额计算免赔率”），则双方应严格按照合同约定执行。这是基于《民法典》第四百六十五条“依法成立的合同，受法律保护”以及第五百零九条“当事人应当按照约定全面履行自己的义务”的规定。
   示例：若合同约定“每次事故免赔率为10%，最低免赔额为500元”，且损失金额为1万元，则先按10%计算免赔额为1000元，再与最低免赔额500元比较，取较高者1000元作为最终免赔金额，保险公司仅赔付9000元。

2. 合同未明确约定时，可能引发争议
   若合同未明确免赔额和免赔率的计算顺序，则可能因理解分歧产生争议。此时需结合以下原则处理：

   • 不利解释原则：根据《保险法》第三十条，对合同条款有两种以上解释的，人民法院或仲裁机构应当作出有利于被保险人和受益人的解释。若被保险人主张先计算免赔率（因免赔率可能因损失金额不同而变化，先计算可能减少免赔金额），而保险公司主张先扣除免赔额，则可能倾向于支持被保险人的解释。
     
   • 行业惯例或交易习惯：若保险行业存在普遍认可的计算顺序（如先免赔率后免赔额），且被保险人明知或应知，则可能按行业惯例处理。但需注意，行业惯例的适用需以合同未明确约定为前提。
     
   • 协商或诉讼解决：若双方无法达成一致，可通过协商、仲裁或诉讼解决。法院或仲裁机构会综合合同条款、目的、行业惯例及公平原则等因素进行裁决。

3. 实务建议

   • 对投保人：签订合同时务必仔细阅读免赔条款，明确免赔额和免赔率的计算顺序及具体金额/比例。若对条款有疑问，可要求保险公司书面说明或补充约定。
     
   • 对保险公司：应在合同中清晰约定免赔额和免赔率的计算顺序及示例，避免因条款模糊引发纠纷。同时，在理赔时主动向被保险人解释计算过程，减少争议。

总结：保险合同中同时约定免赔额和免赔率时，优先按合同明确约定处理；未明确时，可能适用不利解释原则或行业惯例，最终需通过协商、仲裁或诉讼解决。建议双方在合同签订时明确条款，减少后续争议。如有具体合同条款或案例，可进一步向我咨询分析。