综合工时制下，法定节假日安排劳动者工作的，用人单位需支付不低于工资300%的加班费，且不得以调休替代。以下从法律适用、计算方式、特殊情形三个角度展开分析：

1. 法律适用依据

根据《工资支付暂行规定》第十三条及《劳动法》第四十四条，综合工时制下：

• 法定节假日加班：无论劳动者是否超出周期内总工时，均按300%支付加班费（如国庆节、春节等法定假日）。
• 休息日加班：若劳动者在周期内总工时未超标准，休息日工作不视为加班；若超出标准工时，超出部分按150%支付加班费（可调休替代）。

关键点：法定节假日加班费支付与周期内总工时无关，属法定强制义务。

2. 加班费计算方式

• 基数确定：以劳动合同约定的劳动者本人工资标准为准；未约定的，按集体合同或实际履行工资确定。
• 计算公式：
  法定节假日加班费 = 月工资基数 ÷ 21.75天 × 300% × 加班天数
  （例：月工资8000元，国庆加班3天，加班费=8000÷21.75×300%×3≈3310元）

注意：若用人单位已安排调休，仍需支付法定节假日加班费，调休仅适用于休息日加班。

3. 特殊情形处理

• 周期内总工时未超标：法定节假日加班仍需支付300%工资，不可因周期内未超工时而免除。
• 跨周期安排工作：若法定节假日跨越两个综合计算周期，需按实际加班天数分别计算。
• 未支付加班费的法律后果：劳动者可依据《劳动合同法》第八十五条要求用人单位补发，并可能加付50%-100%赔偿金。

建议：用人单位应严格区分法定节假日与休息日加班，避免混淆支付标准；劳动者需保留考勤记录、工资条等证据，以备维权之需。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。