针对您提出的“已经注销的店铺怎么起诉”的问题，这确实是一个涉及消费者权益保护和法律程序的问题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，要明确的是，即使店铺已经注销，您仍然有权通过法律途径来维护自己的合法权益。根据相关法律法规，市场主体在办理注销登记前，应当依法履行义务、清偿费用。如果店铺在未清偿债务或未履行相关义务的情况下就进行了注销登记，那么其股东、发起人或者出资人可能需要承担相应的法律责任。
具体操作步骤如下：
收集证据：
- 您需要收集与店铺之间的交易记录、合同、付款凭证、沟通记录等所有相关证据。
- 如果可能的话，还可以收集店铺注销前的相关公告、通知或信息，以证明店铺在注销前未履行相关义务。
确定被告：
- 根据店铺的性质（如有限责任公司、个体工商户等），确定可能的被告。
- 如果店铺是有限责任公司且未经依法清算即注销，您可以考虑将股东作为被告。
- 如果店铺是个体工商户，且经营者是个人，那么您可以直接将经营者作为被告。
撰写起诉状：
- 起诉状应明确列明原告、被告的基本信息、诉讼请求、事实与理由等。
- 在事实与理由部分，详细阐述您与店铺之间的交易情况、店铺注销的情况以及您因此遭受的损失。
提交起诉状至法院：
- 将起诉状及相关证据提交至有管辖权的法院。
- 法院在受理案件后，会安排开庭审理，并根据事实和法律规定作出判决。
参与庭审并等待判决：
- 在庭审过程中，您需要陈述事实、提供证据并回答法官的询问。
- 庭审结束后，法院会作出判决，并告知您判决结果和上诉权利。
额外建议：
- 在起诉前，您可以尝试与店铺的股东或经营者进行协商，看是否能够达成和解协议，以节省时间和成本。
- 如果您对法律程序不熟悉或担心自己的权益无法得到充分保障，可以考虑咨询专业律师或寻求法律援助机构的帮助。
案例参考：
- 类似您的情况，有消费者在培训机构注销后成功通过法律途径维护了自己的合法权益。在该案例中，消费者购买了培训课程并支付了费用，但培训机构在未退还剩余费用的情况下就进行了注销登记。最终，法院判决培训机构的股东承担连带清偿责任，退还了消费者的剩余费用。
综上所述，即使店铺已经注销，您仍然有权通过法律途径来维护自己的合法权益。希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。