结论前置：签了离职协议后，劳动者在特定情况下仍然有权申请劳动仲裁。关键在于协议内容是否合法、有效，以及劳动者的权益是否得到充分保障。以下是对此问题的详细分析：

一、可以申请劳动仲裁的情形

1. 协议无效或可撤销

   • 欺诈、胁迫或乘人之危：若劳动者能证明离职协议是在欺诈、胁迫或乘人之危的情况下签订的，该协议可能被认定为无效或可撤销。例如，单位以不签字就不办理离职手续相威胁，迫使劳动者接受不合理的离职条件。此时，劳动者可就相关劳动争议申请仲裁。
   • 显失公平：若协议内容显失公平，如补偿标准明显低于法律规定，对劳动者造成重大损害，劳动者同样有权申请仲裁。比如，应支付3个月工资的经济补偿，但协议仅支付1个月且劳动者被迫签字。

2. 协议未涵盖所有争议事项

   • 即使离职协议合法有效，但若其中未涉及某些重要的劳动争议事项（如加班费、未休年假工资、未支付的奖金等），劳动者仍可就这些未涉及的事项申请仲裁。例如，协议中只约定了经济补偿金，但未提及加班费，劳动者可以就加班费部分申请仲裁。

3. 协议内容违法

   • 如果离职协议的内容本身违反法律法规的强制性规定，如免除用人单位的法定责任、排除劳动者权利等，劳动者可以依法申请劳动仲裁，要求撤销或变更该协议。例如，协议中约定劳动者放弃社保权益，这是违法的，劳动者可以主张相关权利。

4. 单位未履行协议约定

   • 离职协议中可能包含关于工资支付、经济补偿金、社保缴纳等方面的约定。如果用人单位未按照协议约定履行义务，劳动者可以就这些未履行的部分申请劳动仲裁。例如，协议约定离职后10日内支付经济补偿金，但单位逾期未付，劳动者可以申请仲裁要求支付。

二、申请劳动仲裁的注意事项

1. 时效问题

   • 劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从劳动者知道或应当知道权利被侵害之日起计算。因此，劳动者在发现权益受到侵害后，应及时申请仲裁，以免错过时效。例如，协议约定离职后10日内付款，单位逾期未付，劳动者需在1年内申请仲裁。

2. 证据收集

   • 劳动者在申请劳动仲裁前，应尽可能收集相关证据，如离职协议、工资单、社保缴纳记录、沟通记录（证明欺诈/胁迫）、工作记录等，以支持自己的主张。证据的完整性和真实性对于仲裁结果至关重要。

3. 明确仲裁请求

   • 在申请仲裁时，劳动者应明确自己的仲裁请求，包括要求用人单位支付的金额、履行的义务等。同时，应提供充分的证据和理由来支持自己的请求。例如，如果要求支付加班费，需要提供加班记录、工资条等证据。

4. 遵循法律程序

   • 劳动者在申请仲裁时，应遵循法律程序，按照仲裁委员会的要求提交相关材料，并按时参加仲裁庭审。不遵守法律程序可能导致仲裁请求被驳回。

三、建议行动步骤

1. 检查协议内容：确认赔偿金额、支付方式及期限是否符合约定，以及是否存在违法或显失公平的条款。
2. 保留证据：保存协议原件、付款凭证、沟通记录、工作记录等证据，以备仲裁时使用。
3. 及时咨询：若对协议效力存疑或遇到法律问题，及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。
4. 申请仲裁：向当地劳动人事争议仲裁委员会提交申请，明确诉求及依据，并按照法律程序进行仲裁。

总结：离职协议的签订并不意味着劳动者放弃了申请劳动仲裁的权利。在协议存在瑕疵、内容违法或未涵盖所有争议事项的情况下，劳动者仍可依法申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。