结论：中介层层转包办理工作签证的行为，其合法性需根据具体情况判断，但多数情况下可能涉及违法或违规操作，存在较大法律风险。
一、合法性分析
直接办理工作签证的合法性：
- 根据我国相关法律法规，办理工作签证需满足一系列条件，包括但不限于：雇主需具备合法资质、提供真实有效的雇佣合同、符合规定的薪资标准等。
- 若中介直接以合法雇主的名义，按照正规流程为申请人办理工作签证，且所有手续均合法合规，那么这种行为是合法的。
层层转包的合法性：
- 转包行为本身：在办理工作签证的过程中，若中介将业务层层转包给其他不具备合法资质或能力的机构或个人，这种行为可能违反相关法律法规，特别是关于中介服务管理的规定。
- 法律后果：层层转包可能导致办理过程失控，增加欺诈、虚假材料等风险，一旦被发现，不仅中介可能面临法律责任，申请人也可能因签证问题而遭受损失，如被拒签、遣返等。
二、可能涉及的法律风险
欺诈风险：
- 层层转包可能滋生欺诈行为，如中介或转包方收取高额费用后消失，或提供虚假材料导致申请人签证被拒。
违规操作风险：
- 转包方可能为了降低成本或提高效率，采取违规操作，如使用虚假雇佣合同、伪造薪资证明等，这些行为一旦被发现，将严重影响申请人的签证申请和未来入境。
法律责任风险：
- 若中介或转包方的行为违反相关法律法规，如《出境入境管理法》、《外国人入境出境管理条例》等，他们可能面临行政处罚甚至刑事责任。同时，申请人也可能因参与违规行为而受到牵连。
三、建议与措施
选择正规中介：
- 申请人在选择中介时，应仔细核查其资质和信誉，选择具有合法经营资质、良好口碑的中介机构。
了解办理流程：
- 申请人应主动了解工作签证的办理流程和要求，确保中介或转包方按照正规流程操作。
保留证据：
- 在办理过程中，申请人应保留好所有相关证据，如合同、付款凭证、沟通记录等，以便在出现问题时维护自己的合法权益。
及时咨询专业律师：
- 若申请人对中介或转包方的行为存在疑虑，或遇到法律问题，应及时咨询专业律师，以便得到专业的法律建议和帮助。
最后，办理工作签证是一个复杂且严肃的过程，涉及诸多法律法规和程序要求。因此，我建议申请人在选择中介和办理过程中务必谨慎小心，确保自己的合法权益不受侵害。若您有任何关于合同纠纷或工作签证办理的法律问题，都可以直接向我咨询。