签订合同如果仅保护甲方的权益，这样的合同并不必然无效，但其效力及执行情况需根据具体条款和法律规定来判断。以下从不同角度进行分析：
合同效力的一般原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是双方意思表示一致的产物，只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方具备相应的民事行为能力，合同即具有法律效力。
- 合同的有效性并不取决于其是否平等保护双方权益，而是取决于合同内容是否合法、合规，以及双方是否自愿签署。
显失公平的合同条款：
- 如果合同中的条款明显偏向甲方，对乙方造成极大的不公平，且这种不公平是乙方在签署合同时无法预见的，或者是在乙方处于明显弱势地位时被迫接受的，那么这样的条款可能构成显失公平。
- 根据《民法典》的规定，显失公平的合同条款，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。因此，如果乙方能够证明合同条款显失公平，那么该条款可能被撤销，从而影响合同的整体效力。
合同中的霸王条款：
- 霸王条款通常指的是一方利用优势地位，在合同中设置对对方明显不利的条款，且这些条款往往违反公平、等价有偿的原则。
- 如果合同中存在霸王条款，这些条款可能因违反法律强制性规定或公序良俗而被认定为无效。然而，需要注意的是，合同中的部分条款无效并不必然导致整个合同无效，除非这些无效条款是合同的核心条款或对合同目的的实现具有决定性影响。
合同的实际履行情况：
- 即使合同在形式上仅保护甲方的权益，但如果在实际履行过程中，双方能够按照合同精神进行协商和调整，使得合同的实际效果并不完全偏向甲方，那么这样的合同仍然可能被视为有效。
- 此外，如果乙方在签署合同时已经充分了解并接受了合同中的不公平条款，且在实际履行过程中没有提出异议，那么这样的合同也可能被视为有效。
法律建议：
- 对于乙方而言，在签署合同前应仔细阅读合同条款，确保自己的权益得到充分保护。如果发现合同中存在显失公平或霸王条款，应及时与甲方进行协商修改或拒绝签署。
- 如果已经签署了存在不公平条款的合同，乙方可以在合同履行过程中或履行后，根据法律规定向人民法院或仲裁机构提出撤销或变更合同的请求。
- 对于甲方而言，虽然可以在合同中设置对自己有利的条款，但应确保这些条款不违反法律强制性规定或公序良俗，且应尊重乙方的合法权益，以维护合同的稳定性和可执行性。
可能后果：
- 如果合同中的不公平条款被撤销或变更，甲方可能需要承担因此产生的法律责任和经济损失。
- 如果合同被认定为整体无效，双方可能需要根据过错程度承担相应的法律责任，并可能面临合同目的无法实现的风险。
如有具体合同纠纷问题，可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况提供详细的法律分析和建议。