在征收拆迁过程中，若村民自治协商的协议内容存在不合法之处，使用复印件并不能改变其违法性，且复印件在法律上的证明力有限，不建议仅依赖复印件来主张权利或履行义务。以下从多个角度进行详细分析：

1. 协议内容的合法性是核心：

   • 无论协议是原件还是复印件，其内容的合法性都是决定其效力的关键因素。如果协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者违背了公序良俗，那么该协议自始无效，不受法律保护。
   • 因此，在征收拆迁过程中，村民自治协商的协议必须严格遵守相关法律法规，确保内容的合法性。

2. 复印件的法律证明力：

   • 复印件作为原件的复制件，其法律证明力通常低于原件。在法律程序中，原件往往被视为更具权威性和可信度的证据。
   • 如果仅提供复印件作为证据，可能会因对方质疑其真实性、完整性或与原件的一致性而面临举证困难。特别是在涉及重大利益如征收拆迁补偿时，对方更可能对复印件的效力提出异议。

3. 应对不合法协议的建议：

   • 审查协议内容：首先，应仔细审查协议内容，确保其符合相关法律法规的规定。如果发现不合法之处，应及时与对方协商修改或废止该协议。
   • 保留原件：在签订协议时，务必保留好原件，并妥善保管。原件是证明协议内容、签订时间、双方签字等关键信息的最直接、最有效的证据。
   • 寻求法律帮助：如果协议内容存在争议或违法之处，且双方无法协商解决，建议及时寻求法律帮助。可以咨询专业律师，了解相关法律法规和维权途径，必要时可以通过法律程序来维护自己的合法权益。

4. 复印件在特定情况下的使用：

   • 虽然复印件的法律证明力有限，但在某些特定情况下，如原件遗失、损坏或无法获取时，复印件仍可能作为辅助证据使用。但此时需要提供其他证据来佐证复印件的真实性、完整性和与原件的一致性。
   • 例如，可以提供签订协议时的见证人证言、录音录像资料等，以增强复印件的证明力。